RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566905.5

PKD1-232, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-232ENST00000566905 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.21■■□□□ 1.15
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PKD1-232ENST00000566905 CCDC69A6NI79 296 aa22.2■■□□□ 1.14
PKD1-232ENST00000566905 SEPT4O43236 478 aa22.2■■□□□ 1.14
PKD1-232ENST00000566905 MSCO60682 206 aa22.2■■□□□ 1.14
PKD1-232ENST00000566905 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.2■■□□□ 1.14
PKD1-232ENST00000566905 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.2■■□□□ 1.14
PKD1-232ENST00000566905 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PKD1-232ENST00000566905 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.2■■□□□ 1.14
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PKD1-232ENST00000566905 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.2■■□□□ 1.14
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PKD1-232ENST00000566905 KRT32Q14532 448 aa22.19■■□□□ 1.14
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PKD1-232ENST00000566905 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.19■■□□□ 1.14
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PKD1-232ENST00000566905 DDAH1O94760 285 aa22.18■■□□□ 1.14
PKD1-232ENST00000566905 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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PKD1-232ENST00000566905 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.18■■□□□ 1.14
PKD1-232ENST00000566905 ARMCX2Q7L311 632 aa22.18■■□□□ 1.14
PKD1-232ENST00000566905 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.18■■□□□ 1.14
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PKD1-232ENST00000566905 HOMER1Q86YM7 354 aa22.18■■□□□ 1.14
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PKD1-232ENST00000566905 LIFRP42702 1097 aa22.17■■□□□ 1.14
PKD1-232ENST00000566905 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.17■■□□□ 1.14
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PKD1-232ENST00000566905 ABCB11O95342 1321 aa22.16■■□□□ 1.14
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PKD1-232ENST00000566905 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.15■■□□□ 1.14
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PKD1-232ENST00000566905 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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PKD1-232ENST00000566905 CALM3P0DP25 149 aa22.13■■□□□ 1.13
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PKD1-232ENST00000566905 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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PKD1-232ENST00000566905 FGD1P98174 961 aa22.12■■□□□ 1.13
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PKD1-232ENST00000566905 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.12■■□□□ 1.13
PKD1-232ENST00000566905 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.12■■□□□ 1.13
PKD1-232ENST00000566905 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.12■■□□□ 1.13
PKD1-232ENST00000566905 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.12■■□□□ 1.13
PKD1-232ENST00000566905 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.12■■□□□ 1.13
PKD1-232ENST00000566905 TBC1D5Q92609 795 aa22.12■■□□□ 1.13
PKD1-232ENST00000566905 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.12■■□□□ 1.13
PKD1-232ENST00000566905 DNM1LO00429 736 aa22.11■■□□□ 1.13
PKD1-232ENST00000566905 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.11■■□□□ 1.13
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