RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 TMEM87BQ96K49 555 aa22.24■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 NEK1Q96PY6 1258 aa22.24■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.24■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 PNMA2Q9UL42 364 aa22.24■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 ASTN1O14525 1302 aa22.24■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.24■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 MSCO60682 206 aa22.23■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 KCNB2Q92953 911 aa22.23■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 MYL10Q9BUA6 226 aa22.23■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 ARMCX2Q7L311 632 aa22.22■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.22■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.22■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.22■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 HSPA4P34932 840 aa22.21■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 LIFRP42702 1097 aa22.21■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.21■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.21■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.21■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 MTMR8Q96EF0 704 aa22.21■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.21■■□□□ 1.15
EDC3-211ENST00000566243 CYTH3O43739 400 aa22.2■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 DDAH1O94760 285 aa22.2■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 REC8O95072 547 aa22.2■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.2■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 FBXO11Q86XK2 927 aa22.2■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 TMTC2Q8N394 836 aa22.2■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 KATNBL1Q9H079 304 aa22.2■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.2■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.19■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 ACVR2BQ13705 512 aa22.19■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 KRT32Q14532 448 aa22.19■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.19■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 MAP3K14Q99558 947 aa22.19■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.19■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.19■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 ABCB11O95342 1321 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 CCDC69A6NI79 296 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 ZBTB5O15062 677 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 COL6A1P12109 1028 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 RXRAP19793 462 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 CALML3P27482 149 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 HOMER1Q86YM7 354 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 TBC1D5Q92609 795 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 PIGSQ96S52 555 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.18■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.17■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 ASB14A6NK59 587 aa22.17■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 AKR1A1P14550 325 aa22.17■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 CPA1P15085 419 aa22.17■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 RGS22Q8NE09 1264 aa22.17■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 AMNQ9BXJ7 453 aa22.17■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.17■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 ADCY6O43306 1168 aa22.16■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 RARBP10826 455 aa22.16■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 MORC4Q8TE76 937 aa22.16■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 DPF3Q92784 378 aa22.16■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.16■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.16■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.16■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.15■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 DNM1LO00429 736 aa22.15■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 OPLAHO14841 1288 aa22.15■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.15■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.15■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 USP26Q9BXU7 913 aa22.15■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.15■■□□□ 1.14
EDC3-211ENST00000566243 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 PGK1P00558 417 aa22.14■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 KIF5BP33176 963 aa22.14■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 LRRC41Q15345 812 aa22.14■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 MICU3Q86XE3 530 aa22.14■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.14■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.14■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 COL20A1Q9P218 1284 aa22.14■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.14■■□□□ 1.13
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