RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563877.5

FAM219B-208, Transcript of family with sequence similarity 219 member B, human

TSL 2

Gene FAM219B, Length 742 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM219B-208	ENST00000563877	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		27.62	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	LAMA4	Q16363	1823 aa		27.62	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	MYADML2	A6NDP7	307 aa		27.61	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		27.61	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	IQCA1	Q86XH1	822 aa		27.61	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		27.61	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	SPC25	Q9HBM1	224 aa		27.61	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	ASTN1	O14525	1302 aa		27.61	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877		B4E1Z4	1266 aa		27.6	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		27.6	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		27.6	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	IL25	Q9H293	177 aa		27.6	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		27.6	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	GJA9	P57773	515 aa		27.59	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		27.59	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	LTBP2	Q14767	1821 aa		27.58	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		27.58	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	NFIB	O00712	420 aa		27.58	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	PNMA1	Q8ND90	353 aa		27.58	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	BAD	Q92934	168 aa		27.58	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	PNMA2	Q9UL42	364 aa		27.58	■■■□□ 2.01
FAM219B-208	ENST00000563877	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	CLTB	P09497	229 aa		27.57	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		27.57	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	TNFAIP2	Q03169	654 aa		27.57	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		27.57	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	GPR153	Q6NV75	609 aa		27.57	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	ANKS1A	Q92625	1134 aa		27.57	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	KRT23	Q9C075	422 aa		27.57	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	KAT14	Q9H8E8	782 aa		27.57	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	ASGR1	P07306	291 aa		27.56	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		27.56	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		27.56	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		27.55	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		27.55	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		27.55	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		27.55	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	CTAGE5	O15320	804 aa		27.54	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	ELP1	O95163	1332 aa		27.54	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	TNKS	O95271	1327 aa		27.54	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	NKX3-2	P78367	333 aa		27.54	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		27.54	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	MORC4	Q8TE76	937 aa		27.54	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	RAD50	Q92878	1312 aa		27.54	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	TOX2	Q96NM4	488 aa		27.54	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		27.54	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	CPVL	Q9H3G5	476 aa		27.54	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		27.54	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		27.53	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		27.53	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		27.53	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		27.53	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		27.53	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		27.53	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	LCT	P09848	1927 aa		27.52	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	KIAA0355	O15063	1070 aa		27.52	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	SMPD1	P17405	629 aa		27.52	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	ITGB8	P26012	769 aa		27.52	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	CHML	P26374	656 aa		27.52	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	CALML3	P27482	149 aa		27.52	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	BEX3	Q00994	111 aa		27.52	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	FAAP100	Q0VG06	881 aa		27.52	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		27.52	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		27.52	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		27.52	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	VTA1	Q9NP79	307 aa		27.52	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		27.52	■■■□□ 2
FAM219B-208	ENST00000563877	TLK2	Q86UE8	772 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FAM219B-208	ENST00000563877	DEFB123	Q8N688	67 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FAM219B-208	ENST00000563877	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FAM219B-208	ENST00000563877	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FAM219B-208	ENST00000563877	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
FAM219B-208	ENST00000563877	RAG1	P15918	1043 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FAM219B-208	ENST00000563877	CDK7	P50613	346 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FAM219B-208	ENST00000563877	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
FAM219B-208	ENST00000563877	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
FAM219B-208	ENST00000563877	SHH	Q15465	462 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FAM219B-208	ENST00000563877	USH1G	Q495M9	461 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FAM219B-208	ENST00000563877	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FAM219B-208	ENST00000563877	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		27.5	■■□□□ 1.99

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