RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 HIPK3Q9H422 1215 aa20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 ASTN1O14525 1302 aa20.53■□□□□ 0.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 SOWAHBA6NEL2 793 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZEB2O60315 1214 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 FGBP02675 491 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 ALAS1P13196 640 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 ITGA7Q13683 1181 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 TKFCQ3LXA3 575 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 GMCL1Q96IK5 515 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 NAPBQ9H115 298 aa20.52■□□□□ 0.88
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF536O15090 1300 aa20.52■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGFBP4P22692 258 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 THEGQ9P2T0 379 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 TTC28Q96AY4 2481 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMPD1P17405 629 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 MCCP23508 829 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPARAQ07869 468 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 DCTPP1Q9H773 170 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 STX8Q9UNK0 236 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 PTGS1P23219 599 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCL23P55773 120 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 ADGRE1Q14246 886 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 KCTD1Q719H9 257 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLA2G6O60733 806 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 SNAP25P60880 206 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 ASB2Q96Q27 587 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q9Y3F1 56 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 GRIN2DO15399 1336 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 MYO9BQ13459 2157 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 TSPY2A6NKD2 308 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 B4GALT4O60513 344 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 PSMC6P62333 389 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 NSMFQ6X4W1 530 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 FSD1Q9BTV5 496 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERC2O15083 957 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 IL27Q8NEV9 243 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 VTA1Q9NP79 307 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 MTMR7Q9Y216 660 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-210ENST00000561256 GBF1Q92538 1859 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 COL9A1P20849 921 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 RABGGTBP53611 331 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZBBXA8MT70 800 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 NMT2O60551 498 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC96Q2M329 555 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 SCLYQ96I15 445 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 MUC3AQ02505 3323 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 ICAM1P05362 532 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 MORC4Q8TE76 937 aa20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 INCENPQ9NQS7 918 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms