RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PQ27	194 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PQ64	194 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PQC6	194 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PQD8	194 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	VAV1	P15498	845 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	CTSK	P43235	329 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	KLF10	Q13118	480 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	TMC4	Q7Z404	712 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM161B	Q96MY7	647 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	USP31	Q70CQ4	1352 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	F13A1	P00488	732 aa		4.47	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.47	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	RTP2	Q5QGT7	225 aa		4.47	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		4.47	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		4.47	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		4.47	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.47	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.47	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.47	□□□□□ -1.69
AKAP13-223	ENST00000560957	AMH	P03971	560 aa		4.46	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	RAG1	P15918	1043 aa		4.46	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	CORO7	P57737	925 aa		4.46	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	LMNB2	Q03252	620 aa		4.46	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMD2	Q13200	908 aa		4.46	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		4.46	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.46	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	ALG3	Q92685	438 aa		4.46	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.46	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.46	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.46	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.46	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PQJ5	194 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957		F6X3S4	739 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	PML	P29590	882 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	MLEC	Q14165	292 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	ARSH	Q5FYA8	562 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	JAML	Q86YT9	394 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	RHOV	Q96L33	236 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF536	O15090	1300 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	ICAM4	Q14773	271 aa		4.44	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.44	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.44	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.44	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	NAT16	Q8N8M0	369 aa		4.44	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.44	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.44	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	MEIS1	O00470	390 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC3A	O75596	197 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	PF4	P02776	101 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	GSN	P06396	782 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	GART	P22102	1010 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNF	P41002	786 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	INHBE	P58166	350 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	MPP2	Q14168	576 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	SURF1	Q15526	300 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM74	Q96NL1	305 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	GMIP	Q9P107	970 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.42	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	IGSF3	O75054	1194 aa		4.42	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	GLI4	P10075	376 aa		4.42	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	TGFB2	P61812	414 aa		4.42	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		4.42	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.42	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.42	□□□□□ -1.7
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.42	□□□□□ -1.7

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