RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 KCNJ6P48051 423 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 PTPRN2Q92932 1015 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 RAXQ9Y2V3 346 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 ATP10BO94823 1461 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 GSG1L2A8MUP6 293 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 H0Y8X5 98 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 APPP05067 770 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 LRRTM3Q86VH5 581 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 HDAC8Q9BY41 377 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 RNF112Q9ULX5 631 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 CHRNA4P43681 627 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 BRAPQ7Z569 592 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 RNF180Q86T96 592 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 C1orf159Q96HA4 380 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 SLC52A2Q9HAB3 445 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 STOML1Q9UBI4 398 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 MCM8Q9UJA3 840 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD3-208ENST00000560725 NAT1P18440 290 aa8.08□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 ADMP35318 185 aa8.08□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 TNK2Q07912 1038 aa8.08□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 AHI1Q8N157 1196 aa8.08□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.08□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 ST14Q9Y5Y6 855 aa8.08□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 SHISA3A0PJX4 238 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 HMX2A2RU54 273 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 PRR33A8MZF0 331 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 MEIS1O00470 390 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
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TMOD3-208ENST00000560725 CTSKP43235 329 aa8.07□□□□□ -1.12
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TMOD3-208ENST00000560725 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 STYK1Q6J9G0 422 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 CD163Q86VB7 1156 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 DCAF4Q8WV16 495 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 STXBP3O00186 592 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 AQP7O14520 342 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 VAMP4O75379 141 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 SRFP11831 508 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 NTRK3Q16288 839 aa8.06□□□□□ -1.12
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TMOD3-208ENST00000560725 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 USP53Q70EK8 1073 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 COPS5Q92905 334 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 TP53INP1Q96A56 240 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 BLACEA4D250 179 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 B4E1Z4 1266 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 AURKAO14965 403 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 NPTXRO95502 500 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 CPEP16870 476 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 IGFALSP35858 605 aa8.05□□□□□ -1.12
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