RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXQ1Q9C009 403 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATG3Q9NT62 314 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 EVC2Q86UK5 1308 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP10DQ9P241 1426 aa11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRR19A6NJB7 356 aa11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATE1O95260 518 aa11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYP27A1Q02318 531 aa11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 PAK2Q13177 524 aa11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM87BQ96K49 555 aa11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 DUSP23Q9BVJ7 150 aa11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 REV1Q9UBZ9 1251 aa11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBR3Q6ZT12 1888 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 CST3P01034 146 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM87AP0C7U9 286 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 IL2RBP14784 551 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC6A19Q695T7 634 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF765Q7L2R6 523 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACBD3Q9H3P7 528 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCSER2Q9H7U1 834 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRDM10Q9NQV6 1147 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 MEGF6O75095 1541 aa11.96□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 GJA8P48165 433 aa11.96□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa11.96□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 DUSP27Q5VZP5 1158 aa11.96□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 TOP6BLQ8N6T0 577 aa11.96□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF112Q9ULX5 631 aa11.96□□□□□ -0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIF13BQ9NQT8 1826 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 C4BP0C0L5 1744 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 LEFTY1O75610 366 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF165P49910 485 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPR162Q16538 588 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYP27C1Q4G0S4 372 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 MFSD2AQ8NA29 543 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 RASGRP4Q8TDF6 673 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPATA32Q96LK8 384 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPRASP2Q96D09 838 aa11.94□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 ITGB4P16144 1822 aa11.94□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 TGFB1P01137 390 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 MCM4P33991 863 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLCQ05315 142 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 PIM2Q9P1W9 311 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 LEMD3Q9Y2U8 911 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1W2PP64 1363 aa11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLITRK5O94991 958 aa11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 POLD1P28340 1107 aa11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 GK5Q6ZS86 529 aa11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 UPK3BL1B0FP48 263 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 UPK3BL2E5RIL1 263 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNAJA2O60884 412 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 YARSP54577 528 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 NME9Q86XW9 330 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM13CQ8NE31 585 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 MIPEPQ99797 713 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCNTO95613 3336 aa11.9□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 EOMESO95936 686 aa11.9□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 TNNI2P48788 182 aa11.9□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM214BQ7L5A3 538 aa11.9□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLHL3Q9UH77 587 aa11.9□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.9□□□□□ -0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR90Q96KV7 1748 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOSL1P15407 271 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 LETMD1Q6P1Q0 360 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 GINM1Q9NU53 330 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 RTL1A6NKG5 1358 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC22A31A6NKX4 558 aa11.88□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYP26A1O43174 497 aa11.88□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 SOX9P48436 509 aa11.88□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 GMIPQ9P107 970 aa11.88□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNRF3Q9ULT6 936 aa11.88□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 RIN3Q8TB24 985 aa11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms