RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.92■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 NPLOC4Q8TAT6 608 aa21.92■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 ABCB11O95342 1321 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 CYTH3O43739 400 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 PGK2P07205 417 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 APOBRQ0VD83 1088 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 CCL14Q16627 93 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 RTN1Q16799 776 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 FBXO11Q86XK2 927 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 HOMER1Q86YM7 354 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 AMNQ9BXJ7 453 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 NID2Q14112 1375 aa21.9■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.9■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 TRAF1Q13077 416 aa21.9■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP2R5BQ15173 497 aa21.9■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.9■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.9■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 MAML3Q96JK9 1138 aa21.9■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.89■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.89■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 NSMFQ6X4W1 530 aa21.89■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PIGSQ96S52 555 aa21.89■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.89■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 NFIBO00712 420 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 EVCP57679 992 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 POTEB2H3BUK9 544 aa21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 MTFR1Q15390 333 aa21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 MAF1Q9H063 256 aa21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CCL5P13501 91 aa21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM32Q13049 653 aa21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF208Q9H0X6 261 aa21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 RPTORQ8N122 1335 aa21.85■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.85■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 IGHA2P01877 340 aa21.85■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.85■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.85■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.85■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.85■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP2C19P33261 490 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CNTN2Q02246 1040 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD1Q15327 319 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 RGS22Q8NE09 1264 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 TINF2Q9BSI4 451 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 CDC27P30260 824 aa21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 SOX10P56693 466 aa21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 FGD4Q96M96 766 aa21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-208ENST00000558954 BRCA2P51587 3418 aa21.83■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 CAPN15O75808 1086 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 CYBAP13498 195 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms