RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557359.5

LINC00645-202, long intergenic non-protein coding RNA 645, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC00645, Length 3,484 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00645-202ENST00000557359 A1BGP04217 495 aa3.58□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 FDPSP14324 419 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 SOX10P56693 466 aa3.58□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 SLC39A6Q13433 755 aa3.58□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 PRR23CQ6ZRP0 262 aa3.58□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 ANP32EQ9BTT0 268 aa3.58□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 PTPRDP23468 1912 aa3.58□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 PRR33A8MZF0 331 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 M0R2C6 588 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 STARD3NLO95772 234 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 PTMSP20962 102 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 RHBDL3P58872 404 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 TEFQ10587 303 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 TATDN1Q6P1N9 297 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 LRRN4Q8WUT4 740 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 MKL1Q969V6 931 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 USP20Q9Y2K6 914 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 A0A0A0MRY4 1105 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 NPR1P16066 1061 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 SELPP16109 830 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 TFCP2Q12800 502 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 RESTQ13127 1097 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 PPP2R5BQ15173 497 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 TEAD4Q15561 434 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 FKBP1CQ5VVH2 108 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 CBLL1Q75N03 491 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 SP8Q8IXZ3 490 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 C4orf32Q8N8J7 132 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 GTF3C6Q969F1 213 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 LEMD3Q9Y2U8 911 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 TAF6LQ9Y6J9 622 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 GSG1L2A8MUP6 293 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 CYP21A2P08686 494 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 SLC35G1Q2M3R5 365 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 LRRC24Q50LG9 513 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 HS1BP3Q53T59 392 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 TBC1D9BQ66K14 1250 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 B3GNT9Q6UX72 402 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 ADGRA1Q86SQ6 560 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 IDI2Q9BXS1 227 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 NYXQ9GZU5 481 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 HSD3B7Q9H2F3 369 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 GREM2Q9H772 168 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 MINPP1Q9UNW1 487 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 AKAP2Q9Y2D5 859 aa3.57□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 REC8O95072 547 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 IARSP41252 1262 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 PLCB2Q00722 1185 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 PTPAQ15257 358 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 NUTM2GQ5VZR2 741 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 CREB3L3Q68CJ9 461 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 RCSD1Q6JBY9 416 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 STAG2Q8N3U4 1231 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 APPBP2Q92624 585 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 OSBP2Q969R2 916 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 BCL2L13Q9BXK5 485 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 PTPRSQ13332 1948 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 A0A0G2JLW4 131 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 PI4K2BG5E9Z4 385 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 H0YGN5 161 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 SRGNP10124 158 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 GJA8P48165 433 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 SARSP49591 514 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 EHHADHQ08426 723 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 GRAPQ13588 217 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 AAK1Q2M2I8 961 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 KLHL40Q2TBA0 621 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 ADCK5Q3MIX3 580 aa3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
LINC00645-202ENST00000557359 LY9Q9HBG7 655 aa3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms