RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 PHF24Q9UPV7 400 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 ADAMTS4O75173 837 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 USH1GQ495M9 461 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 SKAP1Q86WV1 359 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 GDF15Q99988 308 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-208ENST00000555806 E7EWF7 191 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 NCOA7Q8NI08 942 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 MAP4K1Q92918 833 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 KATNBL1Q9H079 304 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 SPC25Q9HBM1 224 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 ASTN1O14525 1302 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 LRRC37A2A6NM11 1700 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 A0A1W2PQY0 241 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 ERICH2A1L162 156 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 ADCY6O43306 1168 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 CALML3P27482 149 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 SEC23AQ15436 765 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 TRIM60Q495X7 471 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 CLEC4DQ8WXI8 215 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 LCTP09848 1927 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 A0A1W2PPC1 479 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 MYADML2A6NDP7 307 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 BMP8BP34820 402 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 TNFAIP2Q03169 654 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 SNX17Q15036 470 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 KCNA10Q16322 511 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 ACLYP53396 1101 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 GJA9P57773 515 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 WTAPQ15007 396 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 CHST3Q7LGC8 479 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 ABCB11O95342 1321 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 VTA1Q9NP79 307 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-208ENST00000555806 DNAH12Q6ZR08 3092 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 KLRF2D3W0D1 207 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 TLE2Q04725 743 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 GNASQ5JWF2 1037 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 TLK2Q86UE8 772 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 FBXO11Q86XK2 927 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-208ENST00000555806 MORC4Q8TE76 937 aa21.45■■□□□ 1.02
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