RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555410.5

WARS-223, Transcript of tryptophanyl-tRNA synthetase, human

TSL 5

Gene WARS, Length 677 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
WARS-223	ENST00000555410	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	FAM122A	Q96E09	287 aa		5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	C12orf42	Q96LP6	360 aa		5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	IL25	Q9H293	177 aa		5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	TMEM51	Q9NW97	253 aa		5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		5.81	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	FLT1	P17948	1338 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	PIEZO1	Q92508	2521 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	SEPT4	O43236	478 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	STX6	O43752	255 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	STRN	O43815	780 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	F13A1	P00488	732 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	GH2	P01242	217 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	CLTB	P09497	229 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	DNAJB2	P25686	324 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	5.8	□□□□□ -1.48	4e-11	■■■■■ 48
WARS-223	ENST00000555410	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	PSEN2	P49810	448 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	TLE2	Q04725	743 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	FPGS	Q05932	587 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	TFCP2	Q12800	502 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	GRIN2C	Q14957	1233 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	NECTIN1	Q15223	517 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	TERF2	Q15554	542 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	CCDC174	Q6PII3	467 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	LBX2	Q6XYB7	198 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	RUFY3	Q7L099	469 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	ZNF384	Q8TF68	577 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	MAP4K1	Q92918	833 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	FERMT2	Q96AC1	680 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	THEG	Q9P2T0	379 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		5.8	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	ELP1	O95163	1332 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	VCAN	P13611	3396 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	IGSF3	O75054	1194 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	CNMD	O75829	334 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	SLFN14	P0C7P3	912 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	RARB	P10826	455 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	ATP5J	P18859	108 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	VCAM1	P19320	739 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	SYT1	P21579	422 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	ADORA2A	P29274	412 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	PPP4C	P60510	307 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	JAG1	P78504	1218 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	LRRC41	Q15345	812 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	ANO1	Q5XXA6	986 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	PI16	Q6UXB8	463 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	RNF180	Q86T96	592 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	CERS3	Q8IU89	383 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	USP38	Q8NB14	1042 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	TRPV1	Q8NER1	839 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	KIF18A	Q8NI77	898 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	PPM1E	Q8WY54	764 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	TIFA	Q96CG3	184 aa		5.79	□□□□□ -1.48
WARS-223	ENST00000555410	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48

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