RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553961.1

ACTN1-AS1-202, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 599 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MYH4Q9Y623 1939 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MROH7Q68CQ1 1323 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 B4DLN1 442 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZEB2O60315 1214 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ADAMTS4O75173 837 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PDHBP11177 359 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RAG1P15918 1043 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TTBK2Q6IQ55 1244 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TBC1D10CQ8IV04 446 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CYP39A1Q9NYL5 469 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PARP14Q460N5 1801 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ELP1O95163 1332 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KDM4AO75164 1064 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF543Q08ER8 600 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TRDNQ13061 729 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MUM1L1Q5H9M0 696 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RASGRP2Q7LDG7 609 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DEFB123Q8N688 67 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BADQ92934 168 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PDLIM7Q9NR12 457 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NEDD4P46934 1319 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ASGR1P07306 291 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GJA9P57773 515 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PNMA1Q8ND90 353 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KLHDC9Q8NEP7 349 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TOX2Q96NM4 488 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 B4E1Z4 1266 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TLR3O15455 904 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CALML3P27482 149 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CST5P28325 142 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TTC22Q5TAA0 569 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RNF207Q6ZRF8 634 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EEPD1Q7L9B9 569 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FGD4Q96M96 766 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 VTA1Q9NP79 307 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ALPK3Q96L96 1907 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LAMA3Q16787 3333 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CABYRO75952 493 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GOLGA8HP0CJ92 632 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PDE4DQ08499 809 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ASPRV1Q53RT3 343 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TLK2Q86UE8 772 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SZT2Q5T011 3432 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FRMPD3Q5JV73 1810 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 WDR19Q8NEZ3 1342 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RAD50Q92878 1312 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ERICH2A1L162 156 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TRIM43BA6NCK2 446 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NFIBO00712 420 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIAA0355O15063 1070 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SNHG28P0DPA3 235 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FPGSQ05932 587 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USH1GQ495M9 461 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZSWIM5Q9P217 1185 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TNKSO95271 1327 aa16■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MYADML2A6NDP7 307 aa16■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARVCFO00192 962 aa16■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SHHQ15465 462 aa16■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MCF2L2Q86YR7 1114 aa16■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa16■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UBA5Q9GZZ9 404 aa16■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 Q9Y3F1 56 aa16■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SMPD1P17405 629 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RPS6P62753 249 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BEX3Q00994 111 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FAAP100Q0VG06 881 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SART3Q15020 963 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms