RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 RELL1Q8IUW5 271 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 ADAMTS10Q9H324 1103 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 ZNF521Q96K83 1311 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 NFIBO00712 420 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 FYB1O15117 783 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 RLBP1P12271 317 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 RAC2P15153 192 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 ETV3P41162 512 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 GAB4Q2WGN9 574 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 ZNF394Q53GI3 561 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 MYOM1P52179 1685 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 CGNL1Q0VF96 1302 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 HPXP02790 462 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 USP48Q86UV5 1035 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 MYLIPQ8WY64 445 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 TMEM74Q96NL1 305 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 SP110Q9HB58 689 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.1□□□□□ -1.27
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TRDN-205ENST00000546248 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PP64 1363 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.09□□□□□ -1.27
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TRDN-205ENST00000546248 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
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TRDN-205ENST00000546248 PDE4BQ07343 736 aa7.09□□□□□ -1.27
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TRDN-205ENST00000546248 PHC3Q8NDX5 983 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 CD320Q9NPF0 282 aa7.09□□□□□ -1.27
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TRDN-205ENST00000546248 TBX22Q9Y458 520 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TRDN-205ENST00000546248 NSD2O96028 1365 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 APAF1O14727 1248 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 TMEM253P0C7T8 217 aa7.08□□□□□ -1.28
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TRDN-205ENST00000546248 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 PWP1Q13610 501 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 SIAH1Q8IUQ4 282 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 DTWD2Q8NBA8 298 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 NLRP1Q9C000 1473 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 TECPR2O15040 1411 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 MED14O60244 1454 aa7.07□□□□□ -1.28
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TRDN-205ENST00000546248 MED14OSP0DP75 135 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.07□□□□□ -1.28
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TRDN-205ENST00000546248 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa7.07□□□□□ -1.28
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TRDN-205ENST00000546248 RNF32Q9H0A6 362 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 DUSP13Q9UII6 198 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 EID1Q9Y6B2 187 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 PTPRUQ92729 1446 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.06□□□□□ -1.28
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