RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 WTAPQ15007 396 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF697Q5TEC3 545 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC174Q6PII3 467 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 NSMFQ6X4W1 530 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 RGS22Q8NE09 1264 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 DNERQ8NFT8 737 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF146Q9NTX7 359 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ABCB11O95342 1321 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR19Q8NEZ3 1342 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 B4E1Z4 1266 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 FOXP2O15409 715 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 NMT2O60551 498 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 COBLO75128 1261 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 CABYRO75952 493 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 PGK2P07205 417 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 PDE4AP27815 886 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 PSMA5P28066 241 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 CCL14Q16627 93 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 REPS2Q8NFH8 660 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP4K1Q92918 833 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM87BQ96K49 555 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM161BQ96MY7 647 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP3K14Q99558 947 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 AMNQ9BXJ7 453 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 Q9Y3F1 56 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 NEDD4P46934 1319 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 LTBP2Q14767 1821 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 MYH4Q9Y623 1939 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 SMIM22K7EJ46 135 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 PEX10O60683 326 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 DDAH1O94760 285 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 SNHG28P0DPA3 235 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 SYN1P17600 705 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 SMARCA1P28370 1054 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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CLSTN3-215ENST00000544584 ACVR2BQ13705 512 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP2R5BQ15173 497 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 LHX8Q68G74 356 aa6.51□□□□□ -1.37
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CLSTN3-215ENST00000544584 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 ARMCX2Q7L311 632 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO11Q86XK2 927 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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CLSTN3-215ENST00000544584 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 IWS1Q96ST2 819 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 GLT8D2Q9H1C3 349 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 VTA1Q9NP79 307 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 INCENPQ9NQS7 918 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP39A1Q9NYL5 469 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-215ENST00000544584 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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