RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 USH1GQ495M9 461 aa25.54■■□□□ 1.68
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PTPRK-222ENST00000532751 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
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PTPRK-222ENST00000532751 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
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PTPRK-222ENST00000532751 AMNQ9BXJ7 453 aa25.51■■□□□ 1.67
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PTPRK-222ENST00000532751 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.49■■□□□ 1.67
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PTPRK-222ENST00000532751 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
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PTPRK-222ENST00000532751 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRK-222ENST00000532751 RCAN1P53805 252 aa25.44■■□□□ 1.66
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PTPRK-222ENST00000532751 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.44■■□□□ 1.66
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PTPRK-222ENST00000532751 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRK-222ENST00000532751 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.44■■□□□ 1.66
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