RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	RETREG2	Q8NC44	543 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	FGD4	Q96M96	766 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	UIMC1	Q96RL1	719 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	TNN	Q9UQP3	1299 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	ASTN1	O14525	1302 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	EPOP	A6NHQ4	379 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	SMPD1	P17405	629 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	PSMC6	P62333	389 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	CNTN2	Q02246	1040 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	TAP1	Q03518	808 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	GRB10	Q13322	594 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRT40	Q6A162	431 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.37	□□□□□ -0.27	1e-6	■■□□□ 12.8
TXNRD1-223	ENST00000531691	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.37	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	MRE11	P49959	708 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	GJD3	Q8N144	294 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	TNKS	O95271	1327 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	PARP14	Q460N5	1801 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	CYP2C9	P11712	490 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADD2	P35612	726 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	KCNJ6	P48051	423 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	VWCE	Q96DN2	955 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	KCNH6	Q9H252	994 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	CPT1A	P50416	773 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	VTA1	Q9NP79	307 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	GBF1	Q92538	1859 aa		13.33	□□□□□ -0.27
TXNRD1-223	ENST00000531691	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	BMP3	P12645	472 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	BFSP2	Q13515	415 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	MKL1	Q969V6	931 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	CD320	Q9NPF0	282 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	LPXN	O60711	386 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	TTLL1	O95922	423 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYL3	P08590	195 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	RASA1	P20936	1047 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLFN13	Q68D06	897 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	CEP85	Q6P2H3	762 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM160B2	Q86V87	743 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TXNRD1-223	ENST00000531691	SNX27	Q96L92	541 aa		13.32	□□□□□ -0.28

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