RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527265.1

CLNS1A-208, Transcript of chloride nucleotide-sensitive channel 1A, human

TSL 2

Gene CLNS1A, Length 620 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLNS1A-208	ENST00000527265	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	NINJ1	Q92982	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	FAM221A	A4D161	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	PDE8A	O60658	829 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	TRIM13	O60858	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	RASGRP1	O95267	797 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	BPNT1	O95861	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ERVK-24	P63145	666 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	RNF180	Q86T96	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	UBR7	Q8N806	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	CRBN	Q96SW2	442 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	LRRC3	Q9BY71	257 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265		H3BS24	57 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	CILP	O75339	1184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	KATNA1	O75449	491 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	RAB27A	P51159	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	PEX10	O60683	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	DDAH1	O94760	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	MCM4	P33991	863 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	NEK2	P51955	445 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	HK2	P52789	917 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	MPP2	Q14168	576 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	AKAP10	O43572	662 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	CDK8	P49336	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	CASP7	P55210	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62	4e-13	■□□□□ 9.6
CLNS1A-208	ENST00000527265	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	KCT2	Q8NC54	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLNS1A-208	ENST00000527265	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms