RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	WTAP	Q15007	396 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	TKFC	Q3LXA3	575 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	ARMCX2	Q7L311	632 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	TBC1D5	Q92609	795 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	MYL10	Q9BUA6	226 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	LY9	Q9HBG7	655 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	MYADML2	A6NDP7	307 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	PRC1	O43663	620 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	CYTH3	O43739	400 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	PGK1	P00558	417 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	TROAP	Q12815	778 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	GRM4	Q14833	912 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	LTBP2	Q14767	1821 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	KLRF2	D3W0D1	207 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	MSC	O60682	206 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	ADAMTS4	O75173	837 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	RXRA	P19793	462 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	ACVR2B	Q13705	512 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	LRRC41	Q15345	812 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	MTMR8	Q96EF0	704 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	LAMA3	Q16787	3333 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	SZT2	Q5T011	3432 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	ERICH2	A1L162	156 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	DNM1L	O00429	736 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	OPLAH	O14841	1288 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	AKR1A1	P14550	325 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	CPA1	P15085	419 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	CAPN2	P17655	700 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	CALML3	P27482	149 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	COL20A1	Q9P218	1284 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	EVI5	O60447	810 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	RARB	P10826	455 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	SYN1	P17600	705 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	MCM5	P33992	734 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	CASC1	Q6TDU7	716 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	HOMER1	Q86YM7	354 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	FERMT2	Q96AC1	680 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	PIGS	Q96S52	555 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	ABCB11	O95342	1321 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PABPC1-222	ENST00000523555	CTAGE5	O15320	804 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PABPC1-222	ENST00000523555	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PABPC1-222	ENST00000523555	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PABPC1-222	ENST00000523555	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64

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