RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517871.1

RRNAD1-208, Transcript of ribosomal RNA adenine dimethylase domain containing 1, human

TSL 3

Gene RRNAD1, Length 479 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRNAD1-208	ENST00000517871	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	FAM160B2	Q86V87	743 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	GNRH1	P01148	92 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	BCR	P11274	1271 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	XBP1	P17861	261 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	FOSB	P53539	338 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	TRIM29	Q14134	588 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	GBP4	Q96PP9	640 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	CALML3	P27482	149 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	KRT2	P35908	639 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	HERVK_113	P62684	666 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	NR5A1	Q13285	461 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	COG2	Q14746	738 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	HOMER1	Q86YM7	354 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZNF536	O15090	1300 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	ELP1	O95163	1332 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	RAD21	O60216	631 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	HOXD10	P28358	340 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	LBX2	Q6XYB7	198 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	REPS2	Q8NFH8	660 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	AMN	Q9BXJ7	453 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RRNAD1-208	ENST00000517871	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	OPLAH	O14841	1288 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	FDX1	P10109	184 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	PSMC4	P43686	418 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	NAPA	P54920	295 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	PRMT2	P55345	433 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	FCGRT	P55899	365 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	NLRP5	P59047	1200 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	KRT85	P78386	507 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	GHRHR	Q02643	423 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	MCTP1	Q6DN14	999 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	COA7	Q96BR5	231 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	USP28	Q96RU2	1077 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		13.45	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms