RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 SRFP11831 508 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 ARMC5Q96C12 935 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 NWD1Q149M9 1564 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 WNT11O96014 354 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 C9IYK1 514 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 H3BS24 57 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 E9PCH4 1651 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 NAIPQ13075 1403 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 MSH6P52701 1360 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 SLC7A5Q01650 507 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 BNIP3Q12983 259 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 GNPTABQ3T906 1256 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 UBE2FQ969M7 185 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 PRR13Q9NZ81 148 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-225ENST00000515835 DIP2AQ14689 1571 aa8.9□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa8.89□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 ADAMTS4O75173 837 aa8.89□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.89□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.89□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.89□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 SPRED2Q7Z698 418 aa8.89□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.89□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 FLCNQ8NFG4 579 aa8.89□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.89□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 HFM1A2PYH4 1435 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 CD8BP10966 210 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 NCAPHQ15003 741 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 GAB4Q2WGN9 574 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 VHLLQ6RSH7 139 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 SHISA3A0PJX4 238 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 KLF4O43474 513 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 SIGLEC6O43699 453 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.87□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 26.9
PDE4D-225ENST00000515835 IKZF1Q13422 519 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 FXNQ16595 210 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 DCAF15Q66K64 600 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 SHOXO15266 292 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 CD96P40200 585 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 KIAA1211LQ6NV74 962 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 HAUS7Q99871 368 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 HDAC8Q9BY41 377 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.86□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 TRPM2O94759 1503 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 RBL2Q08999 1139 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 TCEAL1Q15170 157 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 Q8N3U1 123 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 NBPF4Q96M43 638 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 GP6Q9HCN6 339 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-225ENST00000515835 CHST7Q9NS84 486 aa8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms