RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514951.5

SMN1-209, Transcript of survival of motor neuron 1, telomeric, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMN1, Length 1,308 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1-209ENST00000514951 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.2■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 RNF146Q9NTX7 359 aa22.2■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.19■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 PFKFB2O60825 505 aa22.19■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 GRB14Q14449 540 aa22.19■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 ME3Q16798 604 aa22.19■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 USH1GQ495M9 461 aa22.19■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.19■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 FBXO11Q86XK2 927 aa22.19■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 USP6NLQ92738 828 aa22.19■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 ARMC5Q96C12 935 aa22.19■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 PNMA2Q9UL42 364 aa22.19■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.18■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.18■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 STRNO43815 780 aa22.18■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 HOXD10P28358 340 aa22.18■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 FLT3LGP49771 235 aa22.18■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 SCRN1Q12765 414 aa22.18■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.18■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.18■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 AMNQ9BXJ7 453 aa22.18■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 ACAD9Q9H845 621 aa22.18■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 FBXO40Q9UH90 709 aa22.18■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.18■■□□□ 1.14
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SMN1-209ENST00000514951 FCER1AP12319 257 aa22.17■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.17■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.17■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 MMP19Q99542 508 aa22.17■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.17■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.17■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 ABCB11O95342 1321 aa22.17■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.16■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 NFIBO00712 420 aa22.16■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 IFNAR1P17181 557 aa22.16■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 ADORA2AP29274 412 aa22.16■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 PRMT2P55345 433 aa22.16■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 IL27Q8NEV9 243 aa22.16■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.16■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 LCTP09848 1927 aa22.16■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 ST18O60284 1047 aa22.15■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 COBLO75128 1261 aa22.15■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 ST3GAL1Q11201 340 aa22.15■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 MAP2K5Q13163 448 aa22.15■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 KCTD2Q14681 263 aa22.15■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 NECAB1Q8N987 351 aa22.15■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 PHKBQ93100 1093 aa22.15■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 GTF3C6Q969F1 213 aa22.15■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 ZNF333Q96JL9 665 aa22.15■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.15■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 OPLAHO14841 1288 aa22.14■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 PPFIA3O75145 1194 aa22.14■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 PGK2P07205 417 aa22.14■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 IRF5Q13568 498 aa22.14■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 RAET1EQ8TD07 263 aa22.14■■□□□ 1.14
SMN1-209ENST00000514951 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.13■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 HOXC6P09630 235 aa22.13■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 CYP2B6P20813 491 aa22.13■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 RGS2P41220 211 aa22.13■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.13■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 CPLX1O14810 134 aa22.12■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 CTDNEP1O95476 244 aa22.12■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 PKN1Q16512 942 aa22.12■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.12■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 APBA2Q99767 749 aa22.12■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.12■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.12■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 TRAF1Q13077 416 aa22.11■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.11■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.11■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 NSMFQ6X4W1 530 aa22.11■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 RGS22Q8NE09 1264 aa22.11■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 TBC1D5Q92609 795 aa22.11■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 DDX11Q96FC9 970 aa22.11■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 PFASO15067 1338 aa22.11■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 DTNBO60941 627 aa22.1■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 CCL14Q16627 93 aa22.1■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.1■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.1■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.1■■□□□ 1.13
SMN1-209ENST00000514951 DPP9Q86TI2 863 aa22.1■■□□□ 1.13
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