RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514305.5

USP53-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 53, humanhuman

TSL 2

Gene USP53, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53-208ENST00000514305 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.45■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 FEM1BQ9UK73 627 aa23.45■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 MYH4Q9Y623 1939 aa23.44■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 FDX1P10109 184 aa23.44■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 GNAQP50148 359 aa23.44■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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USP53-208ENST00000514305 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.44■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.44■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 BRF1Q92994 677 aa23.44■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 MTMR7Q9Y216 660 aa23.44■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.43■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 PLA2G6O60733 806 aa23.43■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 SLC25A27O95847 323 aa23.43■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 PDHBP11177 359 aa23.43■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 COL6A1P12109 1028 aa23.43■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 CPA1P15085 419 aa23.43■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.43■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.43■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 ZBTB43O43298 467 aa23.42■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 FCER1AP12319 257 aa23.42■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 SYN1P17600 705 aa23.42■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 STAT2P52630 851 aa23.42■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.42■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.42■■□□□ 1.34
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USP53-208ENST00000514305 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.41■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 SNHG28P0DPA3 235 aa23.41■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 CYBAP13498 195 aa23.41■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 MCM2P49736 904 aa23.41■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.41■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.41■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 TMEM232C9JQI7 657 aa23.4■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 BMP8BP34820 402 aa23.4■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 ZNF543Q08ER8 600 aa23.4■■□□□ 1.34
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USP53-208ENST00000514305 APOA5Q6Q788 366 aa23.4■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 GDF15Q99988 308 aa23.4■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.4■■□□□ 1.34
USP53-208ENST00000514305 COBLO75128 1261 aa23.39■■□□□ 1.33
USP53-208ENST00000514305 COPB2P35606 906 aa23.39■■□□□ 1.33
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USP53-208ENST00000514305 TRPV1Q8NER1 839 aa23.39■■□□□ 1.33
USP53-208ENST00000514305 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.39■■□□□ 1.33
USP53-208ENST00000514305 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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USP53-208ENST00000514305 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.39■■□□□ 1.33
USP53-208ENST00000514305 DNM1LO00429 736 aa23.38■■□□□ 1.33
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USP53-208ENST00000514305 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.38■■□□□ 1.33
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USP53-208ENST00000514305 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.38■■□□□ 1.33
USP53-208ENST00000514305 MAML3Q96JK9 1138 aa23.38■■□□□ 1.33
USP53-208ENST00000514305 MMP19Q99542 508 aa23.38■■□□□ 1.33
USP53-208ENST00000514305 KIF2CQ99661 725 aa23.38■■□□□ 1.33
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USP53-208ENST00000514305 MS4A3Q96HJ5 214 aa23.37■■□□□ 1.33
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USP53-208ENST00000514305 RTN1Q16799 776 aa23.36■■□□□ 1.33
USP53-208ENST00000514305 SENP2Q9HC62 589 aa23.36■■□□□ 1.33
USP53-208ENST00000514305 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.36■■□□□ 1.33
USP53-208ENST00000514305 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
USP53-208ENST00000514305 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
USP53-208ENST00000514305 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
USP53-208ENST00000514305 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.35■■□□□ 1.33
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