RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 MRFAP1Q9Y605 127 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 GPBP1Q86WP2 473 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 AK8Q96MA6 479 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 DNM3Q9UQ16 869 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 TCHHQ07283 1943 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 CXCR5P32302 372 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 CETN2P41208 172 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 GUCY2FP51841 1108 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 RASSF7Q02833 373 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 RPS6KA1Q15418 735 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 POTEJP0CG39 1038 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 ZBED6P86452 979 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 PAK2Q13177 524 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 DGKHQ86XP1 1220 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 RETREG2Q8NC44 543 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 COA7Q96BR5 231 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 A0A1B0GTH6 734 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 SRGAP2O75044 1071 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 NCAPHQ15003 741 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 THAP9Q9H5L6 903 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 PANK4Q9NVE7 773 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 COL15A1P39059 1388 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 TTC26A0AVF1 554 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 TOM1O60784 492 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 CCDC174Q6PII3 467 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 USP40Q9NVE5 1235 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 TSKSQ9UJT2 592 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 HPSEQ9Y251 543 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 TRAF1Q13077 416 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 LGALS16A8MUM7 142 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 RNF40O75150 1001 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 GCNT3O95395 438 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 MYL1P05976 194 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 C2orf54Q08AI8 447 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 NR1I3Q14994 352 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 EXOC4Q96A65 974 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 C3P01024 1663 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 FLOT1O75955 427 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 ACTN2P35609 894 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 PRPHP41219 470 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 MAP3K14Q99558 947 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 KCNK3O14649 394 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 SCNN1DP51172 638 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 ADAM9Q13443 819 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 FAM182BQ5T319 152 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 PEX26Q7Z412 305 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms