RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498478.1

ITGB6-210, Transcript of integrin subunit beta 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB6, Length 705 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6-210ENST00000498478 DCAF4Q8WV16 495 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 COPS5Q92905 334 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 RNF112Q9ULX5 631 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 OPA1O60313 960 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 RASGRP1O95267 797 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 VAV1P15498 845 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 BMP8BP34820 402 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 OXCT1P55809 520 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 ZNF460Q14592 562 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 ARNTLO00327 626 aa8.74□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 CRTAMO95727 393 aa8.74□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 ASLP04424 464 aa8.74□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 NEK4P51957 841 aa8.74□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.74□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 STYK1Q6J9G0 422 aa8.74□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.74□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.74□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.74□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 KLHL42Q9P2K6 505 aa8.74□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 WDR64B1ANS9 1081 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 SYPP08247 313 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 GSTM1P09488 218 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 SEPHS1P49903 392 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 NFIAQ12857 509 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 STRA8Q7Z7C7 330 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 HOMER2Q9NSB8 354 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 ATG3Q9NT62 314 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 H3BS24 57 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 AQP7O14520 342 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 MARCH6O60337 910 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 PDGFRBP09619 1106 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 PLS3P13797 630 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 IGFALSP35858 605 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 AHI1Q8N157 1196 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 UBE2FQ969M7 185 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 MTFR1LQ9H019 292 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 CLEC1BQ9P126 229 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGB6-210ENST00000498478 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 KPNA6O60684 536 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 ZNF205O95201 554 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 JMJD7P0C870 316 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 GUCY1A3Q02108 690 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 RTP2Q5QGT7 225 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 FERMT3Q86UX7 667 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 CCDC103Q8IW40 242 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 ATL2Q8NHH9 583 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 MCM8Q9UJA3 840 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 CFAP100Q494V2 611 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 KSR1Q8IVT5 923 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 TCFL5Q9UL49 500 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 FKTNO75072 461 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 CEACAM5P06731 702 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 LCP1P13796 627 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 FLT3P36888 993 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 LTBRP36941 435 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB6-210ENST00000498478 GPR85P60893 370 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms