RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490316.6

MTMR1-211, Transcript of myotubularin related protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MTMR1, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1-211ENST00000490316 ACLYP53396 1101 aa34.21■■■■□ 3.07
MTMR1-211ENST00000490316 KCNA10Q16322 511 aa34.21■■■■□ 3.07
MTMR1-211ENST00000490316 LRIT3Q3SXY7 679 aa34.21■■■■□ 3.07
MTMR1-211ENST00000490316 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
MTMR1-211ENST00000490316 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
MTMR1-211ENST00000490316 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
MTMR1-211ENST00000490316 NUP133Q8WUM0 1156 aa34.2■■■■□ 3.07
MTMR1-211ENST00000490316 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
MTMR1-211ENST00000490316 SPC25Q9HBM1 224 aa34.2■■■■□ 3.07
MTMR1-211ENST00000490316 PNMA2Q9UL42 364 aa34.2■■■■□ 3.07
MTMR1-211ENST00000490316 ASTN1O14525 1302 aa34.2■■■■□ 3.07
MTMR1-211ENST00000490316 LTBP2Q14767 1821 aa34.19■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 CST5P28325 142 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 TLE2Q04725 743 aa34.19■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 PNMA1Q8ND90 353 aa34.19■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 ANKS1AQ92625 1134 aa34.19■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 KRT23Q9C075 422 aa34.19■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 PDLIM7Q9NR12 457 aa34.19■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 ZSWIM5Q9P217 1185 aa34.19■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 MYADML2A6NDP7 307 aa34.18■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 GJA9P57773 515 aa34.18■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 KAT14Q9H8E8 782 aa34.18■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 CNNM2Q9H8M5 875 aa34.18■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 STARD7Q9NQZ5 370 aa34.18■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 RAD50Q92878 1312 aa34.18■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 LAMA3Q16787 3333 aa34.17■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 RUFY2Q8WXA3 655 aa34.17■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 NFIBO00712 420 aa34.16■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 GOLGA8HP0CJ92 632 aa34.16■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 TNFAIP2Q03169 654 aa34.16■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa34.16■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 LCTP09848 1927 aa34.16■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 WDR19Q8NEZ3 1342 aa34.15■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 TRIM43BA6NCK2 446 aa34.15■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 CHMLP26374 656 aa34.15■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 TNKSO95271 1327 aa34.14■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 LRRC37A2A6NM11 1700 aa34.14■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 ASGR1P07306 291 aa34.14■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 GNASQ5JWF2 1037 aa34.14■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 GPR153Q6NV75 609 aa34.14■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 MORC4Q8TE76 937 aa34.14■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 CLEC4DQ8WXI8 215 aa34.14■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 GLT1D1Q96MS3 346 aa34.14■■■■□ 3.06
MTMR1-211ENST00000490316 PTPDC1A2A3K4 754 aa34.13■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 CLTBP09497 229 aa34.13■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 NKX3-2P78367 333 aa34.13■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 BADQ92934 168 aa34.13■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 UBA5Q9GZZ9 404 aa34.13■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 ELP1O95163 1332 aa34.12■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 TAPT1Q6NXT6 567 aa34.12■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 EEPD1Q7L9B9 569 aa34.12■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa34.12■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 TOX2Q96NM4 488 aa34.12■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 UBAC1Q9BSL1 405 aa34.12■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 CPVLQ9H3G5 476 aa34.12■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa34.11■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 CTAGE5O15320 804 aa34.11■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 IQSEC1Q6DN90 963 aa34.11■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 RNF207Q6ZRF8 634 aa34.11■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 VTA1Q9NP79 307 aa34.11■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 PDGFCQ9NRA1 345 aa34.11■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 ASPRV1Q53RT3 343 aa34.1■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 SLC30A10Q6XR72 485 aa34.1■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 DCDC2CA8MYV0 355 aa34.09■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 SMPD1P17405 629 aa34.09■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 CALML3P27482 149 aa34.09■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 TLK2Q86UE8 772 aa34.09■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 VTI1AQ96AJ9 217 aa34.09■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 KIAA0355O15063 1070 aa34.08■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 BEX3Q00994 111 aa34.08■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 PTH1RQ03431 593 aa34.08■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 FAAP100Q0VG06 881 aa34.08■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 ADGRF4Q8IZF3 695 aa34.08■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 TMEM39AQ9NV64 488 aa34.08■■■■□ 3.05
MTMR1-211ENST00000490316 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
MTMR1-211ENST00000490316 ITGB8P26012 769 aa34.07■■■■□ 3.04
MTMR1-211ENST00000490316 RPS6P62753 249 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
MTMR1-211ENST00000490316 TRDNQ13061 729 aa34.07■■■■□ 3.04
MTMR1-211ENST00000490316 USH1GQ495M9 461 aa34.07■■■■□ 3.04
MTMR1-211ENST00000490316 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa34.07■■■■□ 3.04
MTMR1-211ENST00000490316 AP5M1Q9H0R1 490 aa34.07■■■■□ 3.04
MTMR1-211ENST00000490316 Q9Y3F1 56 aa34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms