RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 NSMCE1Q8WV22 266 aa18.77■□□□□ 0.6
NISCH-213ENST00000489895 ADAM9Q13443 819 aa18.77■□□□□ 0.6
NISCH-213ENST00000489895 CIAPIN1Q6FI81 312 aa18.77■□□□□ 0.6
NISCH-213ENST00000489895 ARMCX5Q6P1M9 558 aa18.77■□□□□ 0.6
NISCH-213ENST00000489895 TRIM58Q8NG06 486 aa18.77■□□□□ 0.6
NISCH-213ENST00000489895 CARD6Q9BX69 1037 aa18.77■□□□□ 0.6
NISCH-213ENST00000489895 TRIM7Q9C029 511 aa18.77■□□□□ 0.6
NISCH-213ENST00000489895 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.65e-7■■□□□ 14.5
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NISCH-213ENST00000489895 CLIC6Q96NY7 704 aa18.77■□□□□ 0.6
NISCH-213ENST00000489895 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.6
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NISCH-213ENST00000489895 AMFRQ9UKV5 643 aa18.77■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 LPXNO60711 386 aa18.76■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 STAT2P52630 851 aa18.76■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 ARMC9Q7Z3E5 817 aa18.76■□□□□ 0.59
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NISCH-213ENST00000489895 ASIC3Q9UHC3 531 aa18.76■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 MMP1P03956 469 aa18.76■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 ERCC3P19447 782 aa18.76■□□□□ 0.59
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NISCH-213ENST00000489895 ZNF577Q9BSK1 485 aa18.76■□□□□ 0.59
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NISCH-213ENST00000489895 MYO3BQ8WXR4 1341 aa18.76■□□□□ 0.59
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NISCH-213ENST00000489895 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
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NISCH-213ENST00000489895 AXIN2Q9Y2T1 843 aa18.75■□□□□ 0.59
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NISCH-213ENST00000489895 SLC27A3Q5K4L6 730 aa18.75■□□□□ 0.59
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NISCH-213ENST00000489895 SPICE1Q8N0Z3 855 aa18.75■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 IGKV5-2P06315 115 aa18.75■□□□□ 0.59
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NISCH-213ENST00000489895 COL15A1P39059 1388 aa18.74■□□□□ 0.59
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NISCH-213ENST00000489895 ODR4Q5SWX8 454 aa18.74■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 MYO1AQ9UBC5 1043 aa18.74■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
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NISCH-213ENST00000489895 NACC1Q96RE7 527 aa18.73■□□□□ 0.59
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NISCH-213ENST00000489895 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa18.73■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 MAP7D1Q3KQU3 841 aa18.73■□□□□ 0.59
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NISCH-213ENST00000489895 TBCKQ8TEA7 893 aa18.73■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 RAB17Q9H0T7 212 aa18.73■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 AFF2P51816 1311 aa18.73■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa18.73■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 LRRIQ4A6NIV6 560 aa18.73■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 XPOTO43592 962 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 CDK8P49336 464 aa18.73■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 ADKP55263 362 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 CYP4A11Q02928 519 aa18.73■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 FANCLQ9NW38 375 aa18.73■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 PDE6CP51160 858 aa18.73■□□□□ 0.59
NISCH-213ENST00000489895 BPIFB4P59827 614 aa18.73■□□□□ 0.59
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