RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 MOCS3O95396 460 aa11.43□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 SCG2P13521 617 aa11.43□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 VAV2P52735 878 aa11.43□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.43□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 ANAPC4Q9UJX5 808 aa11.43□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 LONP1P36776 959 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 ZBED6P86452 979 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 PDCLQ13371 301 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 IQCEQ6IPM2 695 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC70Q6NSX1 233 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 IQCA1Q86XH1 822 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 MMGT1Q8N4V1 131 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 SH2D3CQ8N5H7 860 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 FAM107BQ9H098 131 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 NCK2O43639 380 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 TRAPPC10P48553 1259 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 FAM47AQ5JRC9 791 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 AMOTL1Q8IY63 956 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC170Q8IYT3 715 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 SH3GL2Q99962 352 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 MYH3P11055 1940 aa11.42□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 SHTN1A0MZ66 631 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 GOLGA8KD6RF30 607 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 SPA17Q15506 151 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 KCTD16Q68DU8 428 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 ANKRD40Q6AI12 368 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 MCTP2Q6DN12 878 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 KCNV1Q6PIU1 500 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC42Q96M95 316 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 DUOX1Q9NRD9 1551 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 LRP5O75197 1615 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 EPHB6O15197 1021 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 DDAH1O94760 285 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 CALM1P0DP23 149 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 CALM2P0DP24 149 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 CALM3P0DP25 149 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 ATP1A2P50993 1020 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 MIIPQ5JXC2 388 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 SLC4A9Q96Q91 983 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 ARAP2Q8WZ64 1704 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 PLCH1Q4KWH8 1693 aa11.41□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 TACC1O75410 805 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 RHOBTB3O94955 611 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 INPP5BP32019 993 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 KCNB1Q14721 858 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC178Q5BJE1 867 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 HAUS3Q68CZ6 603 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 C2CD5Q86YS7 1000 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 TRIM58Q8NG06 486 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 HPS3Q969F9 1004 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 SH2D4AQ9H788 454 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 DTHD1Q6ZMT9 781 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 GBP6Q6ZN66 633 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 GPATCH11Q8N954 259 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 P2RX5Q93086 422 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 NUP58Q9BVL2 599 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 TSGA10Q9BZW7 698 aa11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
VWA3B-217ENST00000489630 SLIT2O94813 1529 aa11.4□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 USP17L12C9JPN9 530 aa11.39□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 USP17L21D6R901 530 aa11.39□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 NDUFAB1O14561 156 aa11.39□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 OPA1O60313 960 aa11.39□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 ZEB2O60315 1214 aa11.39□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 KRT14P02533 472 aa11.39□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 FCER1AP12319 257 aa11.39□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 UBA7P41226 1012 aa11.39□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 GYG1P46976 350 aa11.39□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 EPHB4P54760 987 aa11.39□□□□□ -0.59
VWA3B-217ENST00000489630 STK4Q13043 487 aa11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms