RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SENP6-210ENST00000487548 H0Y8X5 98 aa5.49□□□□□ -1.53
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SENP6-210ENST00000487548 GSNP06396 782 aa5.49□□□□□ -1.53
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SENP6-210ENST00000487548 EHMT1Q9H9B1 1298 aa5.47□□□□□ -1.53
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SENP6-210ENST00000487548 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
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SENP6-210ENST00000487548 NOP2P46087 812 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
SENP6-210ENST00000487548 PPP2R5DQ14738 602 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-210ENST00000487548 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
SENP6-210ENST00000487548 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-210ENST00000487548 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP5.42□□□□□ -1.54
SENP6-210ENST00000487548 FBXO33Q7Z6M2 555 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-210ENST00000487548 PPFIBP1Q86W92 1011 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-210ENST00000487548 NKD1Q969G9 470 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-210ENST00000487548 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.42□□□□□ -1.54
SENP6-210ENST00000487548 GP6Q9HCN6 339 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-210ENST00000487548 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-210ENST00000487548 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
SENP6-210ENST00000487548 PRR13Q9NZ81 148 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP6-210ENST00000487548 FBLN5Q9UBX5 448 aa5.42□□□□□ -1.54
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