RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474147.5

RBMS1-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 2

Gene RBMS1, Length 2,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-208	ENST00000474147	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	TSKS	Q9UJT2	592 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	NDUFA10	O95299	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	KRT16	P08779	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	RARA	P10276	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CDC25A	P30304	524 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	NCALD	P61601	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CBX3	Q13185	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MED23	Q9ULK4	1368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PREX2	Q70Z35	1606 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	AFF2	P51816	1311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	RCCD1	A6NED2	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147		H0YGN5	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	IL13	P35225	146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	USP46	P62068	366 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PHEX	P78562	749 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SEPT2	Q15019	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PKN1	Q16512	942 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	NCSTN	Q92542	709 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ARHGEF10	O15013	1369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	COL15A1	P39059	1388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	FLOT1	O75955	427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	BAG3	O95817	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	GLI1	P08151	1106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	GSTT1	P30711	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	KLC1	Q07866	573 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MORC3	Q14149	939 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	NLRP3	Q96P20	1036 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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