RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	ITK	Q08881	620 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	NR5A1	Q13285	461 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	SP140	Q13342	867 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	KRT72	Q14CN4	511 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	SPATC1	Q76KD6	591 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	BEND5	Q7L4P6	421 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	SUN5	Q8TC36	379 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	SPATA18	Q8TC71	538 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	RADIL	Q96JH8	1075 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	CNDP1	Q96KN2	507 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	CRB3	Q9BUF7	120 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	SENP2	Q9HC62	589 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	MCM8	Q9UJA3	840 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC66	A2RUB6	948 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TISP43	B9A030	160 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398		B9A039	149 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	MAP3K6	O95382	1288 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	GUCA1C	O95843	209 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	MT-ND3	P03897	115 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	CENPA	P49450	140 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	ERVK-9	P63128	1117 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	SEPT6	Q14141	434 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	ODF1	Q14990	250 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	PPA1	Q15181	289 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TCEA2	Q15560	299 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	MAJIN	Q3KP22	176 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	NIM1K	Q8IY84	436 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	LRRC43	Q8N309	656 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TMC1	Q8TDI8	760 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	PPM1M	Q96MI6	270 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	NEK1	Q96PY6	1258 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	RSAD1	Q9HA92	442 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM165	Q9HC07	324 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TNKS	O95271	1327 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	ANO9	A1A5B4	782 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TULP2	O00295	520 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	P4HA2	O15460	535 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	GDF9	O60383	454 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	PCNA	P12004	261 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	KRT13	P13646	458 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TMOD1	P28289	359 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	HOXC12	P31275	282 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	ATP6V1E1	P36543	226 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	HADHA	P40939	763 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	ATP1A2	P50993	1020 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	TGFB2	P61812	414 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	PRR20E	P86478	221 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTC3-214	ENST00000472398	PRR20C	P86479	221 aa		3.67	□□□□□ -1.82

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