RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469025.1

OPTN-209, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-209ENST00000469025 FBXL6Q8N531 539 aa7.32□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 LILRB5O75023 590 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 CETPP11597 493 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 ELP3Q9H9T3 547 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 TMEM221A6NGB7 291 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 FAM177BA6PVY3 158 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 M0R296 226 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 BBOX1O75936 387 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 MICAL2O94851 1124 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 MAP3K6O95382 1288 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 FURINP09958 794 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 IL9P15248 144 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 LEXMQ3ZCV2 418 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 EDAQ92838 391 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 NYXQ9GZU5 481 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 IGFLR1Q9H665 355 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 SLC28A3Q9HAS3 691 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 MSRAQ9UJ68 235 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 AK9Q5TCS8 1911 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 SPTA1P02549 2419 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 GRXCR1A8MXD5 290 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 FAM229AH3BQW9 127 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 TAF4O00268 1085 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 GATA4P43694 442 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 KIAA2013Q8IYS2 634 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 PDLIM7Q9NR12 457 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 NAGPAQ9UK23 515 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 ABCC4O15439 1325 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 TRIM43BA6NCK2 446 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 AVPR2P30518 371 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 VCPP55072 806 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 SLC39A6Q13433 755 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 PCSK7Q16549 785 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 OCLNQ16625 522 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 RASIP1Q5U651 963 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 NACC1Q96RE7 527 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 DEFB129Q9H1M3 183 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 ITPR3Q14573 2671 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-209ENST00000469025 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 PRMT3O60678 531 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 ZP2Q05996 745 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 STK32AQ8WU08 396 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 NUDT8Q8WV74 236 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 IFT43Q96FT9 208 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 ZFATQ9P243 1243 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 COL4A1P02462 1669 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 ECM29Q5VYK3 1845 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 OPLAHO14841 1288 aa7.26□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 ATG7O95352 703 aa7.26□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 FPGSQ05932 587 aa7.26□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 DOC2BQ14184 412 aa7.26□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.26□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 EPHA10Q5JZY3 1008 aa7.26□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 COX20Q5RI15 118 aa7.26□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 KRT25Q7Z3Z0 450 aa7.26□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.26□□□□□ -1.25
OPTN-209ENST00000469025 FAM35AQ86V20 835 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms