RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	15.82	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	DDX11	Q96FC9	970 aa		15.82	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	ERO1A	Q96HE7	468 aa		15.82	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCG2	P13521	617 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR142	Q7Z601	462 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHST13	Q8NET6	341 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNX21	Q969T3	373 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM47	Q96LD4	638 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACAD9	Q9H845	621 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	FBXO40	Q9UH90	709 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABCB11	O95342	1321 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	JAK2	O60674	1132 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	DEXI	O95424	95 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	FCER1A	P12319	257 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTGF	P29279	349 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCTD2	Q14681	263 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARHGEF6	Q15052	776 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	NSMF	Q6X4W1	530 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	MMP19	Q99542	508 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYH6	P13533	1939 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	NFIB	O00712	420 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	NAPA	P54920	295 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	PKN1	Q16512	942 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	STRN	O43815	780 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	CFB	P00751	764 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAP1	Q01518	475 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	BARHL2	Q9NY43	387 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	STXBP3	O00186	592 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTPRE	P23469	700 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	HOXD10	P28358	340 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	DPP9	Q86TI2	863 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	WASF1	Q92558	559 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	AIFM3	Q96NN9	605 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	STK36	Q9NRP7	1315 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM17	Q9Y577	477 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		15.77	■□□□□ 0.12
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	PGK2	P07205	417 aa		15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	CALML3	P27482	149 aa		15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADORA2A	P29274	412 aa		15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	FOSB	P53539	338 aa		15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBC1D5	Q92609	795 aa		15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALG1	Q9BT22	464 aa		15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		15.77	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMCO2	A6NFE2	343 aa		15.76	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	XBP1	P17861	261 aa		15.76	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYP2B6	P20813	491 aa		15.76	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		15.76	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		15.76	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		15.76	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		15.76	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	GABRQ	Q9UN88	632 aa		15.76	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		15.76	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	PFAS	O15067	1338 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	GNRH1	P01148	92 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	FLT3LG	P49771	235 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	NLRP5	P59047	1200 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRKCZ	Q05513	592 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	CUL4A	Q13619	759 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM29	Q14134	588 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRB14	Q14449	540 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	BECN1	Q14457	450 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	CUL5	Q93034	780 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	SRRD	Q9UH36	339 aa		15.75	■□□□□ 0.11
SELENBP1-208	ENST00000447402	GJD2	Q9UKL4	321 aa		15.75	■□□□□ 0.11

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