RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 EN2P19622 333 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS6KB1P23443 525 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP2C19P33261 490 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAF1Q13077 416 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 QRICH1Q2TAL8 776 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 FANCBQ8NB91 859 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 TINF2Q9BSI4 451 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP39A1Q9NYL5 469 aa19.6■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCB11O95342 1321 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 ZBTB5O15062 677 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 CYTH3O43739 400 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 RCAN1P53805 252 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC35G1Q2M3R5 365 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 APOA5Q6Q788 366 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXO11Q86XK2 927 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 TCEANC2Q96MN5 208 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB118Q96PH6 123 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 MYL10Q9BUA6 226 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 SPZ1Q9BXG8 430 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 AMNQ9BXJ7 453 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 AGXT2Q9BYV1 514 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa19.58■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
RABGEF1-204ENST00000442563 ANAPC15P60006 121 aa19.58■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 RUFY3Q7L099 469 aa19.58■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 BRPF3Q9ULD4 1205 aa19.58■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa19.57■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 NFIBO00712 420 aa19.57■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 MSCO60682 206 aa19.57■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 CYBAP13498 195 aa19.57■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 CPA1P15085 419 aa19.57■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 CASTP20810 708 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 FGD1P98174 961 aa19.57■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP2R5BQ15173 497 aa19.57■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 NSMFQ6X4W1 530 aa19.57■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 Q6ZUG5 572 aa19.57■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 IL17RAQ96F46 866 aa19.57■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 FGD4Q96M96 766 aa19.57■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 SOWAHBA6NEL2 793 aa19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 ZBTB43O43298 467 aa19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 TFRCP02786 760 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 CNTN2Q02246 1040 aa19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 USH1GQ495M9 461 aa19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF207Q6ZRF8 634 aa19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 MCF2L2Q86YR7 1114 aa19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 SAMD3Q8N6K7 520 aa19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 TRPV1Q8NER1 839 aa19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 SHISA4Q96DD7 197 aa19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 PIGSQ96S52 555 aa19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 ASB14A6NK59 587 aa19.55■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 RXRAP19793 462 aa19.55■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 EVCP57679 992 aa19.55■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 LHX8Q68G74 356 aa19.55■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 MICU3Q86XE3 530 aa19.55■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 OGDHLQ9ULD0 1010 aa19.55■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 CNPY2Q9Y2B0 182 aa19.55■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa19.55■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 CENPFP49454 3210 aa19.55■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa19.54■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 PTPDC1A2A3K4 754 aa19.54■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 SEPT4O43236 478 aa19.54■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS6P62753 249 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 GHRHRQ02643 423 aa19.54■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa19.54■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 TMTC3Q6ZXV5 915 aa19.54■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 HOMER1Q86YM7 354 aa19.54■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKLE1Q8NAG6 615 aa19.54■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 BRF1Q92994 677 aa19.54■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa19.54■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 SMCHD1A6NHR9 2005 aa19.53■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 PLEKHA8P1O95397 391 aa19.53■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 SEC24BO95487 1268 aa19.53■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 CNGA1P29973 690 aa19.53■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 RTN1Q16799 776 aa19.53■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 C8orf34Q49A92 452 aa19.53■□□□□ 0.72
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms