RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCTD1Q719H9 257 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CPXCR1Q8N123 301 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMTC2Q8N394 836 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PNMA1Q8ND90 353 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRIB2Q92519 343 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MMP19Q99542 508 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAF1Q9H063 256 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PARP14Q460N5 1801 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TNKSO95271 1327 aa9.53□□□□□ -0.88
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TK2O00142 265 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DPYSL4O14531 572 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGHA2P01877 340 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EN2P19622 333 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MCM5P33992 734 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SEC23AQ15436 765 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SKAP1Q86WV1 359 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DDX11Q96FC9 970 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NRBP1Q9UHY1 535 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLXNB2O15031 1838 aa9.52□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC27A2O14975 620 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MSCO60682 206 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 COBLO75128 1261 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ICAM1P05362 532 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRT32Q14532 448 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCL14Q16627 93 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF792Q3KQV3 632 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CREB3L3Q68CJ9 461 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CYB5R4Q7L1T6 521 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM87BQ96K49 555 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAP3K14Q99558 947 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ACAD9Q9H845 621 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MTMR7Q9Y216 660 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RIPK3Q9Y572 518 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF236Q9UL36 1845 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF536O15090 1300 aa9.51□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 REC8O95072 547 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TFRCP02786 760 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LIFRP42702 1097 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRAF1Q13077 416 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WTAPQ15007 396 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STOX1Q6ZVD7 989 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAML3Q96JK9 1138 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DEFB118Q96PH6 123 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EPAS1Q99814 870 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TINF2Q9BSI4 451 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PFASO15067 1338 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.5□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.49□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALAS1P13196 640 aa9.49□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SMARCA1P28370 1054 aa9.49□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC16A2P36021 539 aa9.49□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC4A3P48751 1232 aa9.49□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRIM32Q13049 653 aa9.49□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.49□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC174Q6PII3 467 aa9.49□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.49□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RGS22Q8NE09 1264 aa9.49□□□□□ -0.89
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCNB2Q92953 911 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms