RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428946.5

LRRC23-204, Transcript of leucine rich repeat containing 23, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC23, Length 969 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23-204ENST00000428946 A0A1W2PQY0 241 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 FDX1P10109 184 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 PDHBP11177 359 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 ACVR2BQ13705 512 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 PDLIM7Q9NR12 457 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 FAM184BQ9ULE4 1060 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 POTEB2H3BUK9 544 aa21.42■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 TNKSO95271 1327 aa21.42■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.42■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.42■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 Q7L0L9 218 aa21.42■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.42■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 ANKS1AQ92625 1134 aa21.42■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 SOWAHBA6NEL2 793 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 E7EWF7 191 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 TLE2Q04725 743 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 TRDNQ13061 729 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 PNMA1Q8ND90 353 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 KAT14Q9H8E8 782 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 CCPG1Q9ULG6 757 aa21.41■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 ASTN1O14525 1302 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 GOLGA8HP0CJ92 632 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 SNHG28P0DPA3 235 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF543Q08ER8 600 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 BADQ92934 168 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 KATNBL1Q9H079 304 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.4■■□□□ 1.02
LRRC23-204ENST00000428946 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 PTGS1P23219 599 aa21.39■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 ACLYP53396 1101 aa21.39■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 KCNA10Q16322 511 aa21.39■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 TKFCQ3LXA3 575 aa21.39■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.39■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.39■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 NSMFQ6X4W1 530 aa21.39■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.39■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 CDC45O75419 566 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 ICAM1P05362 532 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 SEC23AQ15436 765 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 CHST3Q7LGC8 479 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 NCOA7Q8NI08 942 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 CLTBP09497 229 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 ITGB8P26012 769 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 DEFB123Q8N688 67 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 CPVLQ9H3G5 476 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.37■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 NFIBO00712 420 aa21.36■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 SLC27A2O14975 620 aa21.36■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.36■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.36■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 CASC1Q6TDU7 716 aa21.36■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 BEX3Q00994 111 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 NECTIN1Q15223 517 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 SHHQ15465 462 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 SENP2Q9HC62 589 aa21.35■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 ASB14A6NK59 587 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 ASGR1P07306 291 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 GJA9P57773 515 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 ANTXR2P58335 489 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 TNFAIP2Q03169 654 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 SPC25Q9HBM1 224 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.34■■□□□ 1.01
LRRC23-204ENST00000428946 CTAGE5O15320 804 aa21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms