RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 STAT2P52630 851 aa27.57■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 DEFB129Q9H1M3 183 aa27.57■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 PRR29P0C7W0 189 aa27.57■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 TXLNAP40222 546 aa27.57■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa27.57■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 FBXO11Q86XK2 927 aa27.57■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 IQUBQ8NA54 791 aa27.57■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 PRR12Q9ULL5 1215 aa27.57■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 SARSP49591 514 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 E2F4Q16254 413 aa27.56■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa27.56■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 SNAP25P60880 206 aa27.55■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 FAM83BQ5T0W9 1011 aa27.55■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 ISM2Q6H9L7 571 aa27.55■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 GPC2Q8N158 579 aa27.55■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 AOPEPQ8N6M6 819 aa27.55■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 EDIL3O43854 480 aa27.55■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 SPATA20Q8TB22 786 aa27.55■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 SMARCE1Q969G3 411 aa27.55■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 PAGE5Q96GU1 130 aa27.55■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 GINM1Q9NU53 330 aa27.55■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 GPRC5DQ9NZD1 345 aa27.55■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 AK8Q96MA6 479 aa27.54■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC39Q9UFE4 941 aa27.54■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 PLA2G6O60733 806 aa27.53■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 CHURC1Q8WUH1 139 aa27.53■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 MAN1B1Q9UKM7 699 aa27.53■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 PPP4R3AQ6IN85 833 aa27.53■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 POTEDQ86YR6 584 aa27.53■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 CCSER1Q9C0I3 900 aa27.53■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 USP17L15C9J2P7 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 USP17L13C9JLJ4 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 USP17L11C9JVI0 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 USP17L18D6R9N7 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 USP17L22D6RA61 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 USP17L17D6RBQ6 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 USP17L19D6RCP7 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 USP17L20D6RJB6 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 SMC2O95347 1197 aa27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 CDC25AP30304 524 aa27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 USP17L24Q0WX57 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 USP17L6PQ6QN14 398 aa27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 TRIML1Q8N9V2 468 aa27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 MTMR9Q96QG7 549 aa27.52■■■□□ 2
SERF1B-201ENST00000380750 TDP2O95551 362 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 AFMP43652 599 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 USH1GQ495M9 461 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 MCTP2Q6DN12 878 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 PDXDC2PQ6P474 469 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 SARM1Q6SZW1 724 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 MEIS2O14770 477 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 BMP6P22004 513 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 TRAF1Q13077 416 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 AP3B2Q13367 1082 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 CALCRLQ16602 461 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 FAM160B2Q86V87 743 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 TRPM4Q8TD43 1214 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF341Q9BYN7 854 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 DISC1Q9NRI5 854 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 SLC37A4O43826 429 aa27.5■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 PTMAP06454 111 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 UBA7P41226 1012 aa27.5■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 MORC3Q14149 939 aa27.5■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 KARSQ15046 597 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 DCAF15Q66K64 600 aa27.5■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 PP2D1A8MPX8 630 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 SMTNL1A8MU46 457 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 IKBKBO14920 756 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 DPYDQ12882 1025 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 PLA2G4DQ86XP0 818 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 FEZ1Q99689 392 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 TRIM5Q9C035 493 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 FEM1BQ9UK73 627 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 ATAD5Q96QE3 1844 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 ESPNB1AK53 854 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 FAM43AQ8N2R8 423 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 HOOK2Q96ED9 719 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 ANO3Q9BYT9 981 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 STAT6P42226 847 aa27.48■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF75DP51815 510 aa27.48■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 IGSF22Q8N9C0 903 aa27.48■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 MLKLQ8NB16 471 aa27.48■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 KIFC2Q96AC6 838 aa27.48■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 TECP42680 631 aa27.47■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP27.47■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 NCAPHQ15003 741 aa27.47■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 GSDMAQ96QA5 445 aa27.47■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa27.47■■□□□ 1.99
SERF1B-201ENST00000380750 EPS15P42566 896 aa27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms