RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 USH1GQ495M9 461 aa14.58□□□□□ -0.07
CNMD-201ENST00000377962 BRF1Q92994 677 aa14.58□□□□□ -0.07
CNMD-201ENST00000377962 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.58□□□□□ -0.07
CNMD-201ENST00000377962 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.58□□□□□ -0.07
CNMD-201ENST00000377962 LCTP09848 1927 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 DDAH1O94760 285 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 HMGCRP04035 888 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 HOXC6P09630 235 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CCL5P13501 91 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CYP2C19P33261 490 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 COPB2P35606 906 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 AK2P54819 239 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 MICU3Q86XE3 530 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CHST13Q8NET6 341 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 DDX11Q96FC9 970 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 PIGSQ96S52 555 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 ACAD9Q9H845 621 aa14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CENPFP49454 3210 aa14.57□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.57□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 NFIBO00712 420 aa14.57□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CNTN2Q02246 1040 aa14.57□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.57□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.57□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 APOA5Q6Q788 366 aa14.57□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 NSMFQ6X4W1 530 aa14.57□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 HOMER1Q86YM7 354 aa14.57□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.57□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.57□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 IGHA2P01877 340 aa14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 UBXN2AP68543 259 aa14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 ANKRD1Q15327 319 aa14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 TKFCQ3LXA3 575 aa14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 FANCBQ8NB91 859 aa14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 TBC1D5Q92609 795 aa14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 MTMR8Q96EF0 704 aa14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 MAML3Q96JK9 1138 aa14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 FGD4Q96M96 766 aa14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 RNF208Q9H0X6 261 aa14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 FBXO40Q9UH90 709 aa14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 MCM3APO60318 1980 aa14.56□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.55□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 ST18O60284 1047 aa14.55□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 EVCP57679 992 aa14.55□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 FBXO11Q86XK2 927 aa14.55□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 TRPV1Q8NER1 839 aa14.55□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 IL27Q8NEV9 243 aa14.55□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 MAP3K14Q99558 947 aa14.55□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.55□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 ASTN1O14525 1302 aa14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 ZBTB5O15062 677 aa14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 ZBTB43O43298 467 aa14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CALM1P0DP23 149 aa14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CALM2P0DP24 149 aa14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CALM3P0DP25 149 aa14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CDC27P30260 824 aa14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 KIF5BP33176 963 aa14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 SLC30A10Q6XR72 485 aa14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.54□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.53□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.53□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.53□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.53□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.53□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 DEFB118Q96PH6 123 aa14.53□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.53□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.53□□□□□ -0.08
CNMD-201ENST00000377962 RPTORQ8N122 1335 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms