RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357164.3

GM2A-201, Transcript of GM2 ganglioside activator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GM2A, Length 3,896 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2A-201ENST00000357164 TAF1LQ8IZX4 1826 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 NF2P35240 595 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 KRT9P35527 623 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 RCAN1P53805 252 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 PKN1Q16512 942 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 CUL5Q93034 780 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 PHKBQ93100 1093 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 NOD2Q9HC29 1040 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 BTBD18B2RXH4 712 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ORC4O43929 436 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 RXRBP28702 533 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 SLC8A1P32418 973 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 CARSP49589 748 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ZNF568Q3ZCX4 644 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ADSSL1Q8N142 457 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 NCOA7Q8NI08 942 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 TCP11Q8WWU5 503 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 EPSTI1Q96J88 318 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 RABEP2Q9H5N1 569 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 TRPC6Q9Y210 931 aa9.51□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 AFF2P51816 1311 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ERICH2A1L162 156 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 KCNJ18B7U540 433 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 CES2O00748 559 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 RPS6KA3P51812 740 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ZNF844Q08AG5 666 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 KCNJ12Q14500 433 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 TRADDQ15628 312 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 MICALCLQ6ZW33 695 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 AIDAQ96BJ3 306 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 NENFQ9UMX5 172 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 PDLIM1O00151 329 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 GNAZP19086 355 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 TTI2Q6NXR4 508 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ZFAND2BQ8WV99 257 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 CPLX3Q8WVH0 158 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 SH3GL3Q99963 347 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 SLIT2O94813 1529 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 GMNCA6NCL1 334 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 NEBLO76041 1014 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 SEMA3FQ13275 785 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 BIRC2Q13490 618 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ALX1Q15699 326 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 NAALADL2Q58DX5 795 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ERMARDQ5T6L9 678 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 OXER1Q8TDS5 423 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ERGIC2Q96RQ1 377 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 IFT88Q13099 833 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 SCARF1Q14162 830 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 PLS1Q14651 629 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 HGSNATQ68CP4 663 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 EHD2Q9NZN4 543 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 AHCYL1O43865 530 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 SLC7A5Q01650 507 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 CCDC122Q5T0U0 273 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 AGBL2Q5U5Z8 902 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 RETREG2Q8NC44 543 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 RAPGEF5Q92565 580 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 NEUROG2Q9H2A3 272 aa9.49□□□□□ -0.89
GM2A-201ENST00000357164 THAP9Q9H5L6 903 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms