RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 STAT2P52630 851 aa27.57■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 DEFB129Q9H1M3 183 aa27.57■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 PRR29P0C7W0 189 aa27.57■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 TXLNAP40222 546 aa27.57■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa27.57■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 FBXO11Q86XK2 927 aa27.57■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 IQUBQ8NA54 791 aa27.57■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 PRR12Q9ULL5 1215 aa27.57■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 SARSP49591 514 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 E2F4Q16254 413 aa27.56■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa27.56■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 SNAP25P60880 206 aa27.55■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 FAM83BQ5T0W9 1011 aa27.55■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 ISM2Q6H9L7 571 aa27.55■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 GPC2Q8N158 579 aa27.55■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 AOPEPQ8N6M6 819 aa27.55■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 EDIL3O43854 480 aa27.55■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 SPATA20Q8TB22 786 aa27.55■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 SMARCE1Q969G3 411 aa27.55■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 PAGE5Q96GU1 130 aa27.55■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 GINM1Q9NU53 330 aa27.55■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 GPRC5DQ9NZD1 345 aa27.55■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 AK8Q96MA6 479 aa27.54■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC39Q9UFE4 941 aa27.54■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 PLA2G6O60733 806 aa27.53■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 CHURC1Q8WUH1 139 aa27.53■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 MAN1B1Q9UKM7 699 aa27.53■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 PPP4R3AQ6IN85 833 aa27.53■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 POTEDQ86YR6 584 aa27.53■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 CCSER1Q9C0I3 900 aa27.53■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 USP17L15C9J2P7 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 USP17L13C9JLJ4 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 USP17L11C9JVI0 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 USP17L18D6R9N7 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 USP17L22D6RA61 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 USP17L17D6RBQ6 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 USP17L19D6RCP7 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 USP17L20D6RJB6 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 SMC2O95347 1197 aa27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 CDC25AP30304 524 aa27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 USP17L24Q0WX57 530 aa27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 USP17L6PQ6QN14 398 aa27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 TRIML1Q8N9V2 468 aa27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 MTMR9Q96QG7 549 aa27.52■■■□□ 2
SERF1A-202ENST00000354833 TDP2O95551 362 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 AFMP43652 599 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 USH1GQ495M9 461 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 MCTP2Q6DN12 878 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 PDXDC2PQ6P474 469 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 SARM1Q6SZW1 724 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 MEIS2O14770 477 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 BMP6P22004 513 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 TRAF1Q13077 416 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 AP3B2Q13367 1082 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 CALCRLQ16602 461 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 FAM160B2Q86V87 743 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 TRPM4Q8TD43 1214 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF341Q9BYN7 854 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 DISC1Q9NRI5 854 aa27.51■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 SLC37A4O43826 429 aa27.5■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 PTMAP06454 111 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 UBA7P41226 1012 aa27.5■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 MORC3Q14149 939 aa27.5■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 KARSQ15046 597 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 DCAF15Q66K64 600 aa27.5■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 PP2D1A8MPX8 630 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 SMTNL1A8MU46 457 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 IKBKBO14920 756 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 DPYDQ12882 1025 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 PLA2G4DQ86XP0 818 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 FEZ1Q99689 392 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 TRIM5Q9C035 493 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 FEM1BQ9UK73 627 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 ATAD5Q96QE3 1844 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 ESPNB1AK53 854 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 FAM43AQ8N2R8 423 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 HOOK2Q96ED9 719 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 ANO3Q9BYT9 981 aa27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 STAT6P42226 847 aa27.48■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF75DP51815 510 aa27.48■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 IGSF22Q8N9C0 903 aa27.48■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 MLKLQ8NB16 471 aa27.48■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 KIFC2Q96AC6 838 aa27.48■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 TECP42680 631 aa27.47■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP27.47■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 NCAPHQ15003 741 aa27.47■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 GSDMAQ96QA5 445 aa27.47■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa27.47■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 EPS15P42566 896 aa27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms