RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 LRWD1Q9UFC0 647 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 KRT14P02533 472 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 MDH1P40925 334 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 MAGEC3Q8TD91 643 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CD248Q9HCU0 757 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 GDF3Q9NR23 364 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 TSKSQ9UJT2 592 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 B4DLN1 442 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CYP27B1O15528 508 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CYP27A1Q02318 531 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 PPARAQ07869 468 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CEP85LQ5SZL2 805 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 ZNF233A6NK53 670 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 MBD4O95243 580 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 TCIRG1Q13488 830 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 KCTD16Q68DU8 428 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 C6orf89Q6UWU4 347 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 VEZTQ9HBM0 779 aa21.47■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 WNT7AO00755 349 aa21.46■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 LCA5LO95447 670 aa21.46■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 SATB1Q01826 763 aa21.46■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 GUCY1A3Q02108 690 aa21.46■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 MAP3K12Q12852 859 aa21.46■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 EP400NLQ6ZTU2 488 aa21.46■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa21.46■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.46■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa21.46■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.46■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 HINFPQ9BQA5 517 aa21.46■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.46■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 RASSF10A6NK89 507 aa21.45■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 ZNF263O14978 683 aa21.45■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 STAT6P42226 847 aa21.45■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 FUT2Q10981 343 aa21.45■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 TTI2Q6NXR4 508 aa21.45■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 WHAMMQ8TF30 809 aa21.45■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.021e-7■■■■■ 36.1
NOP56-201ENST00000329276 MIEF2Q96C03 454 aa21.45■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.45■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.45■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 SLC40A1Q9NP59 571 aa21.45■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CCDC121Q6ZUS5 278 aa21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 TAX1BP1Q86VP1 789 aa21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 DOCK2Q92608 1830 aa21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 BICDL2A1A5D9 508 aa21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 RHOBTB3O94955 611 aa21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 SEC23AQ15436 765 aa21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 SNCBQ16143 134 aa21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 IQCA1Q86XH1 822 aa21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 MOCS3O95396 460 aa21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 IFT88Q13099 833 aa21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 NPY5RQ15761 445 aa21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CCDC189A1A4V9 331 aa21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 PJA2O43164 708 aa21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 A1BGP04217 495 aa21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 PPP1R2P41236 205 aa21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms