RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 SH2D3CQ8N5H7 860 aa24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC42Q96M95 316 aa24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDCLQ13371 301 aa24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCTD16Q68DU8 428 aa24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLAIN2Q9P270 581 aa24.87■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 NCK2O43639 380 aa24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 IQCEQ6IPM2 695 aa24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM107BQ9H098 131 aa24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 SHTN1A0MZ66 631 aa24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRAPPC10P48553 1259 aa24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD40Q6AI12 368 aa24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP1A2P50993 1020 aa24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPA17Q15506 151 aa24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 MIIPQ5JXC2 388 aa24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 MCTP2Q6DN12 878 aa24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 OSBPL9Q96SU4 736 aa24.85■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 GOLGA8KD6RF30 607 aa24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 EPHB6O15197 1021 aa24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 RHOBTB3O94955 611 aa24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 INPP5BP32019 993 aa24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM58Q8NG06 486 aa24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUP58Q9BVL2 599 aa24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa24.84■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 TACC1O75410 805 aa24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT14P02533 472 aa24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 STK4Q13043 487 aa24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNB1Q14721 858 aa24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 GPATCH11Q8N954 259 aa24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 HPS3Q969F9 1004 aa24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 SALL4Q9UJQ4 1053 aa24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 CALM1P0DP23 149 aa24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 CALM2P0DP24 149 aa24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 CALM3P0DP25 149 aa24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 SH2D4AQ9H788 454 aa24.83■■□□□ 1.57
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L12C9JPN9 530 aa24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L21D6R901 530 aa24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 FCER1AP12319 257 aa24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBA7P41226 1012 aa24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 OPA1O60313 960 aa24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDAH1O94760 285 aa24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 GBP6Q6ZN66 633 aa24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZIM3Q96PE6 472 aa24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 NCAPGQ9BPX3 1015 aa24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 STIM2Q9P246 746 aa24.82■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 NDUFAB1O14561 156 aa24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZEB2O60315 1214 aa24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERCC3P19447 782 aa24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 BLIDQ8IZY5 108 aa24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 RETREG2Q8NC44 543 aa24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 P2RX5Q93086 422 aa24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 MS4A14Q96JA4 679 aa24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 MNAT1P51948 309 aa24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 EPHB4P54760 987 aa24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 RUFY1Q96T51 708 aa24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 USO1O60763 962 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 GYG1P46976 350 aa24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC181Q5TID7 509 aa24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSGA10Q9BZW7 698 aa24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 ESYT3A0FGR9 886 aa24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSF2BPO75031 334 aa24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF11P52732 1056 aa24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms