RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316334.4

LNX2-201, Transcript of ligand of numb-protein X 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LNX2, Length 4,627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2-201ENST00000316334 FAM204AQ9H8W3 233 aa7□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 POTEB2H3BUK9 544 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 IFNAR1P17181 557 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 BRD3Q15059 726 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 RRAGBQ5VZM2 374 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 ICE2Q659A1 982 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 KIAA1328Q86T90 577 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 VSTM4Q8IW00 320 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 OSBP2Q969R2 916 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 IQCDQ96DY2 449 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 MYO6Q9UM54 1294 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 A0A1W2PQ27 194 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 A0A1W2PQ64 194 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 A0A1W2PQD8 194 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 SLC26A4O43511 780 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 KIAA0754O94854 1291 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 CTDNEP1O95476 244 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 SCG2P13521 617 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 SMARCA1P28370 1054 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 CUEDC2Q9H467 287 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 PSMA7O14818 248 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 FOXN1O15353 648 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 ATP8B1O43520 1251 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 CMA1P23946 247 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 CASP7P55210 303 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 SEMA3FQ13275 785 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 GNPTABQ3T906 1256 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 TTC38Q5R3I4 469 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 SLFN13Q68D06 897 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 KRT40Q6A162 431 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 SLC35F6Q8N357 371 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 SLF1Q9BQI6 1058 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 EFCC1Q9HA90 598 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 H0YCG3 227 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 LCORLQ8N3X6 602 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 PPM1EQ8WY54 764 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 MRIQ9BWK5 157 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 AMNQ9BXJ7 453 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 FUT8Q9BYC5 575 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 VPS16Q9H269 839 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 PNMA3Q9UL41 463 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 EBAG9O00559 213 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 FBXO11Q86XK2 927 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 CDHR1Q96JP9 859 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 CSRNP1Q96S65 589 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 SHTN1A0MZ66 631 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 TULP2O00295 520 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 ENC1O14682 589 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 CASP8Q14790 479 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 WDR78Q5VTH9 848 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 BLIDQ8IZY5 108 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 JADE2Q9NQC1 790 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 CDC23Q9UJX2 597 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 UBN2Q6ZU65 1347 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 C21orf2O43822 256 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 ZEB2O60315 1214 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 STX10O60499 249 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 MYL1P05976 194 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 CCT5P48643 541 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 AK8Q96MA6 479 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 IWS1Q96ST2 819 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 FBXO40Q9UH90 709 aa6.98□□□□□ -1.29
LNX2-201ENST00000316334 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms