RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 BMP3P12645 472 aa30.39■■■□□ 2.46
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HOXD8-201ENST00000313173 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
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HOXD8-201ENST00000313173 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP30.28■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 USP17L24Q0WX57 530 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 AP3B2Q13367 1082 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXD8-201ENST00000313173 FAM83BQ5T0W9 1011 aa30.28■■■□□ 2.44
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