RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 TBX22Q9Y458 520 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEF1Q9HAY2 307 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 SUN1O94901 812 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 SETSIPP0DME0 302 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 EXOC3L4Q17RC7 722 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 GSDMAQ96QA5 445 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPN22Q9Y2R2 807 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 IKBKBO14920 756 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 PPM1KQ8N3J5 372 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 EPHB4P54760 987 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 IFT88Q13099 833 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 DPCR1Q3MIW9 517 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 KAZNQ674X7 775 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNQ3O43525 872 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 CHURC1Q8WUH1 139 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 SCYL1Q96KG9 808 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 DBN1Q16643 649 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 RASEFQ8IZ41 740 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF148Q9UQR1 794 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA0556O60303 1618 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC24Q50LG9 513 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 HVCN1Q96D96 273 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 STAP2Q9UGK3 403 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 XKR9Q5GH70 373 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 BCAMP50895 628 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 IL9RQ01113 521 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 SEPT10Q9P0V9 454 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 TNNC2P02585 160 aa26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGEF16Q5VV41 709 aa26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR2MP0CAP2 368 aa26.39■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 GYG1P46976 350 aa26.39■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 ARMCX5Q6P1M9 558 aa26.39■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 DLATP10515 647 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 LMNB1P20700 586 aa26.39■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINB6P35237 376 aa26.39■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC93Q567U6 631 aa26.39■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 HOOK2Q96ED9 719 aa26.39■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.39■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 ZMYND10O75800 440 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 MYL7Q01449 175 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 GLG1Q92896 1179 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 IFNAR2P48551 515 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPN21Q16825 1174 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP4P98171 946 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 C2orf54Q08AI8 447 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 EPB41L5Q9HCM4 733 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 FRMD3A2A2Y4 597 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 TEKT3Q9BXF9 490 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 COG7P83436 770 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 MED10Q9BTT4 135 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 EFCAB13Q8IY85 973 aa26.37■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 NSFP46459 744 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa26.37■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 EEF2KMTQ96G04 330 aa26.37■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 CUEDC2Q9H467 287 aa26.37■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT3P12035 628 aa26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 GTF2IP78347 998 aa26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 MESDQ14696 234 aa26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 GNPTABQ3T906 1256 aa26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 IL17REQ8NFR9 667 aa26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 ORAI2Q96SN7 254 aa26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC127Q96BQ5 260 aa26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 H0YIN7 160 aa26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 CNGA1P29973 690 aa26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 GARSP41250 739 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 GJA10Q969M2 543 aa26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 H0YCG3 227 aa26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 M0QZ92 97 aa26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 LAD1O00515 517 aa26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms