RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298282.13

PKNOX2-201, Transcript of PBX/knotted 1 homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKNOX2, Length 3,687 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-201ENST00000298282 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 TMEM232C9JQI7 657 aa11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 ADAMTS3O15072 1205 aa11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 CDK8P49336 464 aa11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 CDKAL1Q5VV42 579 aa11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 CCDC148Q8NFR7 591 aa11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 CCDC91Q7Z6B0 441 aa11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 PROM2Q8N271 834 aa11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 COA1Q9GZY4 146 aa11.99□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 A0A1B0GTH6 734 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 ESYT2A0FGR8 921 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 TSPY3P0CV98 308 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 TSPY8P0CW00 308 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 NR1I3Q14994 352 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 MKNK2Q9HBH9 465 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 MED4Q9NPJ6 270 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 PSME4Q14997 1843 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 PBX1P40424 430 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 SATB1Q01826 763 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF174Q15697 407 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 SPATA1Q5VX52 437 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 ABCB6Q9NP58 842 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 USP17L3A6NCW0 530 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 USP17L4A6NCW7 530 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 MYL1P05976 194 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 SNHG28P0DPA3 235 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 USP17L1Q7RTZ2 530 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 JAG2Q9Y219 1238 aa11.98□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 MAP9Q49MG5 647 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 CEP89Q96ST8 783 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 CCSER1Q9C0I3 900 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 MYH4Q9Y623 1939 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 CCP110O43303 1012 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 IVLP07476 585 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 TOP1P11387 765 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 TEX11Q8IYF3 940 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 AKT1S1Q96B36 256 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 MTRQ99707 1265 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 MRIQ9BWK5 157 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 RIOX1Q9H6W3 641 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 HSPA1LP34931 641 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 PPP2R5AQ15172 486 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 EYA3Q99504 573 aa11.97□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 PLSCR1O15162 318 aa11.96□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 SERPINC1P01008 464 aa11.96□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 FECHP22830 423 aa11.96□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.96□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa11.96□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 FAXDC2Q96IV6 333 aa11.96□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 FAM204AQ9H8W3 233 aa11.96□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 L1RE1Q9UN81 338 aa11.96□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa11.96□□□□□ -0.49
PKNOX2-201ENST00000298282 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 KRT27Q7Z3Y8 459 aa11.96□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC44A5Q8NCS7 719 aa11.96□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 DESI2Q9BSY9 194 aa11.96□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 SRGNP10124 158 aa11.96□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11.96□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 NRDCO43847 1150 aa11.95□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 ABL1P00519 1130 aa11.95□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 VSNL1P62760 191 aa11.95□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 KCNB1Q14721 858 aa11.95□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 MTF1Q14872 753 aa11.95□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 ITIH6Q6UXX5 1313 aa11.95□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 NPR1P16066 1061 aa11.95□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 TXLNAP40222 546 aa11.95□□□□□ -0.5
PKNOX2-201ENST00000298282 TXNRD1Q16881 649 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms