RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.38■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 LRRC8AQ8IWT6 810 aa21.38■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 CUL5Q93034 780 aa21.38■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 MED15Q96RN5 788 aa21.38■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.37■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 CBFA2T2O43439 604 aa21.37■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.37■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 BLZF1Q9H2G9 400 aa21.37■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.37■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 NDUFB10O96000 172 aa21.36■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 POLD1P28340 1107 aa21.36■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 UBASH3AP57075 661 aa21.36■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 CUL4BQ13620 913 aa21.36■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.36■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 MTMR9Q96QG7 549 aa21.36■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.36■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.36■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 SERPINC1P01008 464 aa21.36■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF18P17022 549 aa21.36■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 GSDMDP57764 484 aa21.36■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 UBE2SQ16763 222 aa21.36■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.36■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.35■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 ARID5BQ14865 1188 aa21.35■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 CABP7Q86V35 215 aa21.35■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 POTEDQ86YR6 584 aa21.35■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 DPF2Q92785 391 aa21.35■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 MTFR1LQ9H019 292 aa21.35■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.35■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 A0A1W2PRG0 241 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 TMC6Q7Z403 805 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 TBC1D12O60347 775 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 BMP3P12645 472 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 TECP42680 631 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 TNNI2P48788 182 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 FAM83AQ86UY5 434 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 CUEDC2Q9H467 287 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 VEZTQ9HBM0 779 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 RMND1Q9NWS8 449 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.34■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 TDP2O95551 362 aa21.33■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 MYL1P05976 194 aa21.33■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 CALCRLQ16602 461 aa21.33■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 SPATA1Q5VX52 437 aa21.33■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.33■■□□□ 1.01
GDPD1-201ENST00000284116 SLC37A4O43826 429 aa21.32■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 TXKP42681 527 aa21.32■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.32■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 MAGEF1Q9HAY2 307 aa21.32■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.32■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 TMEM232C9JQI7 657 aa21.32■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 JDP2Q8WYK2 163 aa21.32■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 PLIN2Q99541 437 aa21.32■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 AMNQ9BXJ7 453 aa21.32■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 TMX2Q9Y320 296 aa21.32■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 SEMA3FQ13275 785 aa21.31■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 PDIA5Q14554 519 aa21.31■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.31■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 LRRC15Q8TF66 581 aa21.31■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.31■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.31■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.31■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 PLCG1P19174 1290 aa21.3■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 CCZ1BP86790 482 aa21.3■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 TNIP1Q15025 636 aa21.3■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 FBXO11Q86XK2 927 aa21.3■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.3■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 USP17L15C9J2P7 530 aa21.29■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.29■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 USP17L11C9JVI0 530 aa21.29■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 USP17L18D6R9N7 530 aa21.29■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 USP17L22D6RA61 530 aa21.29■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.29■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 USP17L19D6RCP7 530 aa21.29■■□□□ 1
GDPD1-201ENST00000284116 USP17L20D6RJB6 530 aa21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms