RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXD9-201ENST00000249499 CALML4Q96GE6 196 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXD9-201ENST00000249499 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXD9-201ENST00000249499 RHOBTB3O94955 611 aa25.77■■□□□ 1.72
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HOXD9-201ENST00000249499 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.77■■□□□ 1.72
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HOXD9-201ENST00000249499 TNNI2P48788 182 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXD9-201ENST00000249499 AP3B2Q13367 1082 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXD9-201ENST00000249499 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
HOXD9-201ENST00000249499 NIM1KQ8IY84 436 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXD9-201ENST00000249499 MYRIPQ8NFW9 859 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXD9-201ENST00000249499 C7orf25Q9BPX7 421 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXD9-201ENST00000249499 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.75■■□□□ 1.71
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