RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.29■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.28■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 ESR2Q92731 530 aa20.28■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 DPF3Q92784 378 aa20.28■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 MAML3Q96JK9 1138 aa20.28■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 TTC14Q96N46 770 aa20.28■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 RIPK3Q9Y572 518 aa20.28■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 RAD50Q92878 1312 aa20.27■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 KCTD1Q719H9 257 aa20.27■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 DCAF4Q8WV16 495 aa20.27■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.27■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.27■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.27■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 IL25Q9H293 177 aa20.27■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PLGRKT-201ENST00000223864 CEP290O15078 2479 aa20.27■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 MSCO60682 206 aa20.26■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 PGK2P07205 417 aa20.26■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 CYBAP13498 195 aa20.26■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 CHMLP26374 656 aa20.26■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 CNGA1P29973 690 aa20.26■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC4A3P48751 1232 aa20.26■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.26■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 TRPV1Q8NER1 839 aa20.26■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 MCM3APO60318 1980 aa20.26■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 NEDD4P46934 1319 aa20.26■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 DDX11Q96FC9 970 aa20.25■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 FBXO40Q9UH90 709 aa20.25■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 MTMR7Q9Y216 660 aa20.25■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.24■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 CHST13Q8NET6 341 aa20.24■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.24■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.23■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 H0YGN5 161 aa20.23■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 KDM4AO75164 1064 aa20.23■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC96Q2M329 555 aa20.23■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.23■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 IQCA1Q86XH1 822 aa20.23■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 DGKHQ86XP1 1220 aa20.23■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 TINF2Q9BSI4 451 aa20.23■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.23■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.23■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.23■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF536O15090 1300 aa20.23■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 MYH6P13533 1939 aa20.22■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 B4E1Z4 1266 aa20.22■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 SEPT4O43236 478 aa20.22■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.22■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.22■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 KRT23Q9C075 422 aa20.22■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.22■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.22■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 PDHBP11177 359 aa20.21■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 PROX2Q3B8N5 592 aa20.21■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 TKFCQ3LXA3 575 aa20.21■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.21■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.21■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.21■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.21■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.21■□□□□ 0.83
PLGRKT-201ENST00000223864 SGSM2O43147 1006 aa20.2■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 SNHG28P0DPA3 235 aa20.2■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 COL6A1P12109 1028 aa20.2■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKS1AQ92625 1134 aa20.2■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 ACAD9Q9H845 621 aa20.2■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.2■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.2■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.19■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC16A2P36021 539 aa20.19■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 PTH1RQ03431 593 aa20.19■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF543Q08ER8 600 aa20.19■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.19■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC174Q6PII3 467 aa20.19■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.19■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.19■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 RNF146Q9NTX7 359 aa20.19■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 ALAS1P13196 640 aa20.18■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 SNAP25P60880 206 aa20.18■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.18■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.18■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 PFASO15067 1338 aa20.18■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.18■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 LCTP09848 1927 aa20.17■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 DNM1LO00429 736 aa20.17■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 ICAM1P05362 532 aa20.17■□□□□ 0.82
PLGRKT-201ENST00000223864 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms