RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222728.3

HOXA6-201, Transcript of homeobox A6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA6, Length 989 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6-201ENST00000222728 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 ARHGEF6Q15052 776 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 NTRK3Q16288 839 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 TKFCQ3LXA3 575 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 CHST13Q8NET6 341 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 AMNQ9BXJ7 453 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 ACAD9Q9H845 621 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 GJD2Q9UKL4 321 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 NFIBO00712 420 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 CPLX1O14810 134 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 FCER1AP12319 257 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 FLT3LGP49771 235 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 MORN1Q5T089 497 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 ABCB11O95342 1321 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 GNRH1P01148 92 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 PGK2P07205 417 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 HOXD10P28358 340 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 ADORA2AP29274 412 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 ST3GAL1Q11201 340 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 GRB14Q14449 540 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 GTF3C6Q969F1 213 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 FBXO40Q9UH90 709 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXA6-201ENST00000222728 IFNAR1P17181 557 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 CYP2B6P20813 491 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 KCTD2Q14681 263 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 NSMFQ6X4W1 530 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 PNMA2Q9UL42 364 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 STRNO43815 780 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 COBLO75128 1261 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 MAP2K5Q13163 448 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 USP6NLQ92738 828 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 CTDNEP1O95476 244 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 DPP9Q86TI2 863 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 RAET1EQ8TD07 263 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 TBC1D5Q92609 795 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 DDX11Q96FC9 970 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 OPLAHO14841 1288 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 RGS2P41220 211 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 ELNP15502 786 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 PRMT2P55345 433 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 CNTN2Q02246 1040 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 PKN1Q16512 942 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 CCL14Q16627 93 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 PFASO15067 1338 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 ADCY3O60266 1144 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 SCG2P13521 617 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 CALML3P27482 149 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 TRAF1Q13077 416 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 TMX3Q96JJ7 454 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 APBA2Q99767 749 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 HTTP42858 3142 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 STXBP3O00186 592 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 JAK2O60674 1132 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 CDKL5O76039 1030 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 CFBP00751 764 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 IRF5Q13568 498 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 IL27Q8NEV9 243 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 AIFM3Q96NN9 605 aa22.83■■□□□ 1.25
HOXA6-201ENST00000222728 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms