RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031145.6

Pdcl2-201, Transcript of Phosducin-like protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdcl2, Length 1,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Palm3A2TJV2 734 aa9.49□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Krt28A6BLY7 462 aa9.49□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tnni2P13412 182 aa9.49□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 NefhP19246 1090 aa9.49□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Eef2P58252 858 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Col6a2Q02788 1034 aa9.49□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mctp2Q5RJH2 878 aa9.49□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Krt40Q6IFX3 439 aa9.49□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam155aQ8CCS2 467 aa9.49□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rnf208Q8K0W3 265 aa9.49□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 GrapQ9CX99 217 aa9.49□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tex21Q9R0U9 575 aa9.49□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tanc1Q0VGY8 1856 aa9.49□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gpr161B2RPY5 545 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm19668J3QMD1 248 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm13128L7MU96 475 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dynll1P63168 89 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fads2p1Q0VAX3 487 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zfp953Q3UPV7 304 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Klhdc9Q3USL1 350 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Olfm4Q3UZZ4 505 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Vps54Q5SPW0 977 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cyp24a1Q64441 514 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lmod1Q8BVA4 595 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tbc1d23Q8K0F1 684 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nek9Q8K1R7 984 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Krt25Q8VCW2 446 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Elp3Q9CZX0 547 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 FliiQ9JJ28 1271 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abcc4E9Q236 1325 aa9.48□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 CerklA2AQH1 525 aa9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Xpnpep3B7ZMP1 506 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mmp8O70138 465 aa9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Eif5P59325 429 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arl14Q3SXC5 192 aa9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pdlim7Q3TJD7 457 aa9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znf692Q3U381 531 aa9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam196bQ6GQV1 535 aa9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Exoc8Q6PGF7 716 aa9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Snapc2Q91XA5 359 aa9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cxxc1Q9CWW7 660 aa9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kcnq4Q9JK97 696 aa9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cfap44E9Q5M6 1843 aa9.47□□□□□ -0.89
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mcmdc2E9Q956 681 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PtpraP18052 829 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Impdh2P24547 514 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Psmc4P54775 418 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tm6sf1P58749 370 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Siah1aP61092 282 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kiaa1468Q148V7 1216 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Wdr70Q3TWF6 657 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 B230104I21RikQ3USW4 141 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 LpoQ5SW46 710 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 GnptabQ69ZN6 1235 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sv2cQ69ZS6 727 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Garem2Q6PAJ3 880 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nme8Q715T0 586 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc7a6osQ7TPE5 306 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mab21L3Q8CI17 429 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prkag2Q91WG5 566 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dclk1Q9JLM8 756 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Deaf1Q9Z1T5 566 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Col11a1Q61245 1804 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adgra3Q7TT36 1310 aa9.46□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Myh4Q5SX39 1939 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Krt24A1L317 512 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 DnttP09838 530 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hoxd10P28359 340 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Igfbp4P47879 254 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dcaf15Q6PFH3 600 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 KhnynQ80U38 671 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam205cQ80YD3 371 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pramel6Q810Y9 485 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam13aQ8BGI4 693 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Golim4Q8BXA1 655 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zbed3Q9D0L1 228 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sept12Q9D451 317 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1700018B08RikQ9DA83 213 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Syt5Q9R0N5 386 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Atrnl1Q6A051 1378 aa9.45□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa9.44□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa9.44□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 DaxxO35613 739 aa9.44□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 L3mbtl2P59178 703 aa9.44□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 SelpQ01102 768 aa9.44□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adck5Q80V03 582 aa9.44□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Itm2cQ91VK4 269 aa9.44□□□□□ -0.9
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fzd5Q9EQD0 585 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.9 ms